RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
PPP1CC-201ENST00000335007 TPRNQ4KMQ1 711 aa24.26■■□□□ 1.47
PPP1CC-201ENST00000335007 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa24.26■■□□□ 1.47
PPP1CC-201ENST00000335007 AP5Z1O43299 807 aa24.25■■□□□ 1.47
PPP1CC-201ENST00000335007 FEZ1Q99689 392 aa24.25■■□□□ 1.47
PPP1CC-201ENST00000335007 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24.25■■□□□ 1.47
PPP1CC-201ENST00000335007 SPDYE4A6NLX3 237 aa24.24■■□□□ 1.47
PPP1CC-201ENST00000335007 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC192P0DO97 292 aa24.24■■□□□ 1.47
PPP1CC-201ENST00000335007 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
PPP1CC-201ENST00000335007 AK2P54819 239 aa24.24■■□□□ 1.47
PPP1CC-201ENST00000335007 IL25Q9H293 177 aa24.24■■□□□ 1.47
PPP1CC-201ENST00000335007 SNX14Q9Y5W7 946 aa24.24■■□□□ 1.47
PPP1CC-201ENST00000335007 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PPP1CC-201ENST00000335007 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
PPP1CC-201ENST00000335007 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.23■■□□□ 1.47
PPP1CC-201ENST00000335007 SPC24Q8NBT2 197 aa24.23■■□□□ 1.47
PPP1CC-201ENST00000335007 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP24.22■■□□□ 1.47
PPP1CC-201ENST00000335007 SYCP1Q15431 976 aa24.22■■□□□ 1.47
PPP1CC-201ENST00000335007 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.22■■□□□ 1.47
PPP1CC-201ENST00000335007 RUFY3Q7L099 469 aa24.21■■□□□ 1.47
PPP1CC-201ENST00000335007 STK31Q9BXU1 1019 aa24.21■■□□□ 1.47
PPP1CC-201ENST00000335007 SGSM2O43147 1006 aa24.21■■□□□ 1.47
PPP1CC-201ENST00000335007 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
PPP1CC-201ENST00000335007 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.21■■□□□ 1.47
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
PPP1CC-201ENST00000335007 NEO1Q92859 1461 aa24.2■■□□□ 1.46
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM200AQ8TCP9 573 aa24.19■■□□□ 1.46
PPP1CC-201ENST00000335007 OGFRQ9NZT2 677 aa24.19■■□□□ 1.46
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PPP1CC-201ENST00000335007 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
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PPP1CC-201ENST00000335007 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.17■■□□□ 1.46
PPP1CC-201ENST00000335007 MTMR6Q9Y217 621 aa24.17■■□□□ 1.46
PPP1CC-201ENST00000335007 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
PPP1CC-201ENST00000335007 PTGS1P23219 599 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP1CC-201ENST00000335007 GJB2P29033 226 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP1CC-201ENST00000335007 FLIIQ13045 1269 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP1CC-201ENST00000335007 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
PPP1CC-201ENST00000335007 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP1CC-201ENST00000335007 SMTNL1A8MU46 457 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP1CC-201ENST00000335007 RAB11FIP3O75154 756 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP1CC-201ENST00000335007 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP1CC-201ENST00000335007 TAF3Q5VWG9 929 aa24.15■■□□□ 1.46
PPP1CC-201ENST00000335007 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.15■■□□□ 1.46
PPP1CC-201ENST00000335007 RASEFQ8IZ41 740 aa24.15■■□□□ 1.46
PPP1CC-201ENST00000335007 CNTROBQ8N137 903 aa24.15■■□□□ 1.46
PPP1CC-201ENST00000335007 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa24.15■■□□□ 1.46
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PPP1CC-201ENST00000335007 MAP3K11Q16584 847 aa24.14■■□□□ 1.46
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PPP1CC-201ENST00000335007 RICTORQ6R327 1708 aa24.14■■□□□ 1.45
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC83Q8IWF9 413 aa24.13■■□□□ 1.45
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PPP1CC-201ENST00000335007 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.13■■□□□ 1.45
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PPP1CC-201ENST00000335007 NUP62CLQ9H1M0 184 aa24.13■■□□□ 1.45
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PPP1CC-201ENST00000335007 PEAK1Q9H792 1746 aa24.12■■□□□ 1.45
PPP1CC-201ENST00000335007 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PPP1CC-201ENST00000335007 TYRO3Q06418 890 aa24.12■■□□□ 1.45
PPP1CC-201ENST00000335007 SSH3Q8TE77 659 aa24.12■■□□□ 1.45
PPP1CC-201ENST00000335007 MRVI1Q9Y6F6 885 aa24.12■■□□□ 1.45
PPP1CC-201ENST00000335007 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.11■■□□□ 1.45
PPP1CC-201ENST00000335007 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
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PPP1CC-201ENST00000335007 VPS53Q5VIR6 699 aa24.11■■□□□ 1.45
PPP1CC-201ENST00000335007 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa24.11■■□□□ 1.45
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PPP1CC-201ENST00000335007 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
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PPP1CC-201ENST00000335007 PDRG1Q9NUG6 133 aa24.1■■□□□ 1.45
PPP1CC-201ENST00000335007 CTNNA3Q9UI47 895 aa24.1■■□□□ 1.45
PPP1CC-201ENST00000335007 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.1■■□□□ 1.45
PPP1CC-201ENST00000335007 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PPP1CC-201ENST00000335007 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC171Q6TFL3 1326 aa24.09■■□□□ 1.45
PPP1CC-201ENST00000335007 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.09■■□□□ 1.45
PPP1CC-201ENST00000335007 DRC7Q8IY82 874 aa24.09■■□□□ 1.45
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
PPP1CC-201ENST00000335007 LUZP1Q86V48 1076 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP1CC-201ENST00000335007 TNNT1P13805 278 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP1CC-201ENST00000335007 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP1CC-201ENST00000335007 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP1CC-201ENST00000335007 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
PPP1CC-201ENST00000335007 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
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