RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000275162.9

CLVS2-201, Transcript of clavesin 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS2, Length 11,485 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS2-201ENST00000275162 CTAGE8P0CG41 777 aa11.91□□□□□ -0.5
CLVS2-201ENST00000275162 DBN1Q16643 649 aa11.91□□□□□ -0.5
CLVS2-201ENST00000275162 CTAGE6Q86UF2 777 aa11.91□□□□□ -0.5
CLVS2-201ENST00000275162 CTAGE4Q8IX94 777 aa11.91□□□□□ -0.5
CLVS2-201ENST00000275162 MYH3P11055 1940 aa11.9□□□□□ -0.5
CLVS2-201ENST00000275162 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CLVS2-201ENST00000275162 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa11.9□□□□□ -0.5
CLVS2-201ENST00000275162 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP11.9□□□□□ -0.5
CLVS2-201ENST00000275162 ZNF428Q96B54 188 aa11.9□□□□□ -0.5
CLVS2-201ENST00000275162 CEP128Q6ZU80 1094 aa11.9□□□□□ -0.5
CLVS2-201ENST00000275162 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa11.9□□□□□ -0.5
CLVS2-201ENST00000275162 GNAI3P08754 354 aa11.9□□□□□ -0.5
CLVS2-201ENST00000275162 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa11.9□□□□□ -0.5
CLVS2-201ENST00000275162 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa11.9□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 DNAI1Q9UI46 699 aa11.9□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 TACC1O75410 805 aa11.89□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 HDGFP51858 240 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 YEATS4O95619 227 aa11.89□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 MAP3K9P80192 1104 aa11.89□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 CCDC155Q8N6L0 562 aa11.89□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 PDRG1Q9NUG6 133 aa11.89□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 KLHL10Q6JEL2 608 aa11.89□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 KIF4AO95239 1232 aa11.89□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 EVC2Q86UK5 1308 aa11.89□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 ELP1O95163 1332 aa11.89□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 ZNF445P59923 1031 aa11.88□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 ERCC3P19447 782 aa11.88□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 VPS36Q86VN1 386 aa11.88□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 CEP131Q9UPN4 1083 aa11.88□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 GNAI2P04899 355 aa11.88□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 PPFIA3O75145 1194 aa11.88□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa11.88□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 AMOTL1Q8IY63 956 aa11.88□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 CPLX4Q7Z7G2 160 aa11.88□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa11.88□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 NOL3O60936 208 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 MAP7Q14244 749 aa11.88□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 TRIM22Q8IYM9 498 aa11.88□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 ICE2Q659A1 982 aa11.87□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 BCL2L12Q9HB09 334 aa11.87□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 JRKLQ9Y4A0 524 aa11.87□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 EFCAB13Q8IY85 973 aa11.87□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 GOPCQ9HD26 462 aa11.87□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 CCDC158Q5M9N0 1113 aa11.87□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 SAMD15Q9P1V8 674 aa11.87□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 RAD50Q92878 1312 aa11.87□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 NDUFAB1O14561 156 aa11.87□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 CACNA1FO60840 1977 aa11.86□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 KDM4AO75164 1064 aa11.86□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 BMP2KLQ5H9B9 411 aa11.86□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 FSD2A1L4K1 749 aa11.86□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 DDX58O95786 925 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.86□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 TRIM4Q9C037 500 aa11.86□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 CNPY4Q8N129 248 aa11.86□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa11.86□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 CCDC174Q6PII3 467 aa11.86□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 SMC5Q8IY18 1101 aa11.86□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 FSD1Q9BTV5 496 aa11.86□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa11.86□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 ZEB2O60315 1214 aa11.86□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa11.86□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 STX6O43752 255 aa11.86□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 PPFIBP2Q8ND30 876 aa11.86□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa11.85□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 USH1CQ9Y6N9 552 aa11.85□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa11.85□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 CKAP2LQ8IYA6 745 aa11.85□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 FKBP15Q5T1M5 1219 aa11.85□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 BCAR3O75815 825 aa11.85□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 FGD6Q6ZV73 1430 aa11.85□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 CCT4P50991 539 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 SRGAP3O43295 1099 aa11.85□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP11.85□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 TRIM7Q9C029 511 aa11.85□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa11.85□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 JADE2Q9NQC1 790 aa11.84□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 NEDD9Q14511 834 aa11.84□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 CCDC40Q4G0X9 1142 aa11.84□□□□□ -0.51
CLVS2-201ENST00000275162 MYH13Q9UKX3 1938 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms