RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VAMP4O75379 141 aa26.06■■□□□ 1.76
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VSIG10Q8N0Z9 540 aa26.06■■□□□ 1.76
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CRBNQ96SW2 442 aa26.05■■□□□ 1.76
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BAG6P46379 1132 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PDE3AQ14432 1141 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C5P01031 1676 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LY75O60449 1722 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC125Q86Z20 511 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LINC00116Q8NCU8 138 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.01■■□□□ 1.75
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TJP1Q07157 1748 aa26■■□□□ 1.75
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A1BGP04217 495 aa26■■□□□ 1.75
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HOXB7P09629 217 aa26■■□□□ 1.75
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIF16BQ96L93 1317 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STARD3NLO95772 234 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANXA1P04083 346 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CACNA1FO60840 1977 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CRKLP46109 303 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SH3BGRL3-201ENST00000270792 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHPF2Q9P2E5 772 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MS4A1P11836 297 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PROSER3Q2NL68 480 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NBPF26B4DH59 902 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NBPF14Q5TI25 921 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NBPF15Q8N660 670 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PDIA6Q15084 440 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC30Q5VVM6 783 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SMIM5Q71RC9 77 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYL6BP14649 208 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC87Q9NVE4 849 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PANK1Q8TE04 598 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC4A2P04920 1241 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STK31Q9BXU1 1019 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF827Q17R98 1081 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP25.9■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TNNQ9UQP3 1299 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GNPATO15228 680 aa25.89■■□□□ 1.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRIM27P14373 513 aa25.89■■□□□ 1.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 G2E3Q7L622 706 aa25.89■■□□□ 1.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C4BP0C0L5 1744 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARHGAP45Q92619 1136 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AK7Q96M32 723 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COG6Q9Y2V7 657 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RLBP1P12271 317 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ERBB4Q15303 1308 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AKT1S1Q96B36 256 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AAMPQ13685 434 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RREB1Q92766 1687 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PHF14O94880 888 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RPS6KA4O75676 772 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARXQ96QS3 562 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HYPKQ9NX55 129 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
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