RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 RFC4P35249 363 aa22.77■■□□□ 1.23
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HOXC6-201ENST00000243108 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
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HOXC6-201ENST00000243108 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.74■■□□□ 1.23
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HOXC6-201ENST00000243108 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.71■■□□□ 1.23
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HOXC6-201ENST00000243108 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.68■■□□□ 1.22
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HOXC6-201ENST00000243108 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.65■■□□□ 1.22
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HOXC6-201ENST00000243108 ZNF521Q96K83 1311 aa22.62■■□□□ 1.21
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HOXC6-201ENST00000243108 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
HOXC6-201ENST00000243108 USP16Q9Y5T5 823 aa22.61■■□□□ 1.21
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HOXC6-201ENST00000243108 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
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HOXC6-201ENST00000243108 APAF1O14727 1248 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXC6-201ENST00000243108 NBPF26B4DH59 902 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXC6-201ENST00000243108 CHRNA5P30532 468 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXC6-201ENST00000243108 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.53■■□□□ 1.2
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HOXC6-201ENST00000243108 RUNDC1Q96C34 613 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXC6-201ENST00000243108 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXC6-201ENST00000243108 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXC6-201ENST00000243108 RIPK4P57078 832 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXC6-201ENST00000243108 GOLGA2Q08379 1002 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXC6-201ENST00000243108 ADCY9O60503 1353 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXC6-201ENST00000243108 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
HOXC6-201ENST00000243108 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXC6-201ENST00000243108 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
HOXC6-201ENST00000243108 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
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