RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000217195.12

C20orf27-201, Transcript of chromosome 20 open reading frame 27, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C20orf27, Length 1,302 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27-201ENST00000217195 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26■■□□□ 1.75
C20orf27-201ENST00000217195 NARFQ9UHQ1 456 aa25.99■■□□□ 1.75
C20orf27-201ENST00000217195 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25.99■■□□□ 1.75
C20orf27-201ENST00000217195 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
C20orf27-201ENST00000217195 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
C20orf27-201ENST00000217195 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.97■■□□□ 1.75
C20orf27-201ENST00000217195 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
C20orf27-201ENST00000217195 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.96■■□□□ 1.75
C20orf27-201ENST00000217195 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
C20orf27-201ENST00000217195 FKBP8Q14318 412 aa25.96■■□□□ 1.75
C20orf27-201ENST00000217195 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
C20orf27-201ENST00000217195 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.95■■□□□ 1.75
C20orf27-201ENST00000217195 MCM10Q7L590 875 aa25.95■■□□□ 1.75
C20orf27-201ENST00000217195 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
C20orf27-201ENST00000217195 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
C20orf27-201ENST00000217195 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
C20orf27-201ENST00000217195 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
C20orf27-201ENST00000217195 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.94■■□□□ 1.74
C20orf27-201ENST00000217195 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
C20orf27-201ENST00000217195 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.93■■□□□ 1.74
C20orf27-201ENST00000217195 TM4SF1P30408 202 aa25.92■■□□□ 1.74
C20orf27-201ENST00000217195 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
C20orf27-201ENST00000217195 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
C20orf27-201ENST00000217195 NFE2L2Q16236 605 aa25.91■■□□□ 1.74
C20orf27-201ENST00000217195 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
C20orf27-201ENST00000217195 DDR1Q08345 913 aa25.89■■□□□ 1.74
C20orf27-201ENST00000217195 DCTN1Q14203 1278 aa25.88■■□□□ 1.73
C20orf27-201ENST00000217195 A0A0G2JLW4 131 aa25.87■■□□□ 1.73
C20orf27-201ENST00000217195 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.86■■□□□ 1.73
C20orf27-201ENST00000217195 NFIXQ14938 502 aa25.86■■□□□ 1.73
C20orf27-201ENST00000217195 PIM2Q9P1W9 311 aa25.86■■□□□ 1.73
C20orf27-201ENST00000217195 KCNQ3O43525 872 aa25.85■■□□□ 1.73
C20orf27-201ENST00000217195 DPEP1P16444 411 aa25.85■■□□□ 1.73
C20orf27-201ENST00000217195 BCS1LQ9Y276 419 aa25.85■■□□□ 1.73
C20orf27-201ENST00000217195 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
C20orf27-201ENST00000217195 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.84■■□□□ 1.73
C20orf27-201ENST00000217195 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.83■■□□□ 1.73
C20orf27-201ENST00000217195 RGL2O15211 777 aa25.83■■□□□ 1.73
C20orf27-201ENST00000217195 A1BGP04217 495 aa25.83■■□□□ 1.73
C20orf27-201ENST00000217195 SERPINB2P05120 415 aa25.82■■□□□ 1.72
C20orf27-201ENST00000217195 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.72
C20orf27-201ENST00000217195 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.82■■□□□ 1.72
C20orf27-201ENST00000217195 USP16Q9Y5T5 823 aa25.82■■□□□ 1.72
C20orf27-201ENST00000217195 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.81■■□□□ 1.72
C20orf27-201ENST00000217195 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.81■■□□□ 1.72
C20orf27-201ENST00000217195 SCN7AQ01118 1682 aa25.8■■□□□ 1.72
C20orf27-201ENST00000217195 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.8■■□□□ 1.72
C20orf27-201ENST00000217195 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
C20orf27-201ENST00000217195 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.8■■□□□ 1.72
C20orf27-201ENST00000217195 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
C20orf27-201ENST00000217195 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.8■■□□□ 1.72
C20orf27-201ENST00000217195 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
C20orf27-201ENST00000217195 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.79■■□□□ 1.72
C20orf27-201ENST00000217195 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
C20orf27-201ENST00000217195 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.79■■□□□ 1.72
C20orf27-201ENST00000217195 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.78■■□□□ 1.72
C20orf27-201ENST00000217195 KCNA3P22001 575 aa25.78■■□□□ 1.72
C20orf27-201ENST00000217195 RIPK4P57078 832 aa25.78■■□□□ 1.72
C20orf27-201ENST00000217195 ADCY9O60503 1353 aa25.78■■□□□ 1.72
C20orf27-201ENST00000217195 CAMTA2O94983 1202 aa25.77■■□□□ 1.72
C20orf27-201ENST00000217195 SETDB2Q96T68 719 aa25.77■■□□□ 1.72
C20orf27-201ENST00000217195 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
C20orf27-201ENST00000217195 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
C20orf27-201ENST00000217195 ATP10DQ9P241 1426 aa25.75■■□□□ 1.71
C20orf27-201ENST00000217195 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
C20orf27-201ENST00000217195 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.75■■□□□ 1.71
C20orf27-201ENST00000217195 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.75■■□□□ 1.71
C20orf27-201ENST00000217195 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
C20orf27-201ENST00000217195 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.74■■□□□ 1.71
C20orf27-201ENST00000217195 RUNDC1Q96C34 613 aa25.74■■□□□ 1.71
C20orf27-201ENST00000217195 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.74■■□□□ 1.71
C20orf27-201ENST00000217195 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.74■■□□□ 1.71
C20orf27-201ENST00000217195 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.73■■□□□ 1.71
C20orf27-201ENST00000217195 H0YIN7 160 aa25.73■■□□□ 1.71
C20orf27-201ENST00000217195 NPHP1O15259 732 aa25.73■■□□□ 1.71
C20orf27-201ENST00000217195 PDE6BP35913 854 aa25.73■■□□□ 1.71
C20orf27-201ENST00000217195 BRIP1Q9BX63 1249 aa25.73■■□□□ 1.71
C20orf27-201ENST00000217195 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.73■■□□□ 1.71
C20orf27-201ENST00000217195 CHRNA5P30532 468 aa25.72■■□□□ 1.71
C20orf27-201ENST00000217195 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
C20orf27-201ENST00000217195 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.72■■□□□ 1.71
C20orf27-201ENST00000217195 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
C20orf27-201ENST00000217195 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa25.72■■□□□ 1.71
C20orf27-201ENST00000217195 ERBB4Q15303 1308 aa25.71■■□□□ 1.71
C20orf27-201ENST00000217195 ST5P78524 1137 aa25.71■■□□□ 1.71
C20orf27-201ENST00000217195 CNBD1Q8NA66 436 aa25.71■■□□□ 1.71
C20orf27-201ENST00000217195 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
C20orf27-201ENST00000217195 BCORQ6W2J9 1755 aa25.71■■□□□ 1.71
C20orf27-201ENST00000217195 NBPF26B4DH59 902 aa25.69■■□□□ 1.7
C20orf27-201ENST00000217195 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
C20orf27-201ENST00000217195 C2CD5Q86YS7 1000 aa25.69■■□□□ 1.7
C20orf27-201ENST00000217195 NBPF15Q8N660 670 aa25.69■■□□□ 1.7
C20orf27-201ENST00000217195 TTLL6Q8N841 843 aa25.69■■□□□ 1.7
C20orf27-201ENST00000217195 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.68■■□□□ 1.7
C20orf27-201ENST00000217195 C1QTNF8P60827 252 aa25.67■■□□□ 1.7
C20orf27-201ENST00000217195 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
C20orf27-201ENST00000217195 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.65■■□□□ 1.7
C20orf27-201ENST00000217195 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.65■■□□□ 1.7
C20orf27-201ENST00000217195 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
C20orf27-201ENST00000217195 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.5 ms