RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 EXOC5O00471 708 aa22.61■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 DDB1Q16531 1140 aa22.6■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.6■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 ATRNO75882 1429 aa22.6■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 BARGINQ6ZT62 677 aa22.6■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 KCNQ3O43525 872 aa22.59■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.59■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 TNS2Q63HR2 1409 aa22.58■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 TEFQ10587 303 aa22.58■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.58■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 EP400Q96L91 3159 aa22.58■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.58■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.58■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 FAM182BQ5T319 152 aa22.57■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.57■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 APBB1O00213 710 aa22.57■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 BECN1Q14457 450 aa22.56■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.56■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 DCAF5Q96JK2 942 aa22.56■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.56■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.56■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 SLC39A6Q13433 755 aa22.55■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.55■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.54■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 BTBD11A6QL63 1104 aa22.54■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.54■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 CACNA1FO60840 1977 aa22.54■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 NFKBIBQ15653 356 aa22.52■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 GNAI2P04899 355 aa22.52■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 CABP4P57796 275 aa22.52■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.52■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.52■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.52■■□□□ 1.2
USP18-201ENST00000215794 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
USP18-201ENST00000215794 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
USP18-201ENST00000215794 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
USP18-201ENST00000215794 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.51■■□□□ 1.19
USP18-201ENST00000215794 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
USP18-201ENST00000215794 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.51■■□□□ 1.19
USP18-201ENST00000215794 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
USP18-201ENST00000215794 ANXA1P04083 346 aa22.49■■□□□ 1.19
USP18-201ENST00000215794 TTC22Q5TAA0 569 aa22.49■■□□□ 1.19
USP18-201ENST00000215794 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
USP18-201ENST00000215794 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.48■■□□□ 1.19
USP18-201ENST00000215794 HMMRO75330 724 aa22.48■■□□□ 1.19
USP18-201ENST00000215794 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.48■■□□□ 1.19
USP18-201ENST00000215794 MRC1P22897 1456 aa22.47■■□□□ 1.19
USP18-201ENST00000215794 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.47■■□□□ 1.19
USP18-201ENST00000215794 GNAI3P08754 354 aa22.47■■□□□ 1.19
USP18-201ENST00000215794 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
USP18-201ENST00000215794 HOXB7P09629 217 aa22.46■■□□□ 1.19
USP18-201ENST00000215794 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.46■■□□□ 1.19
USP18-201ENST00000215794 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
USP18-201ENST00000215794 ITGB4P16144 1822 aa22.46■■□□□ 1.19
USP18-201ENST00000215794 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.46■■□□□ 1.19
USP18-201ENST00000215794 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
USP18-201ENST00000215794 POTEAQ6S8J7 498 aa22.46■■□□□ 1.19
USP18-201ENST00000215794 USP44Q9H0E7 712 aa22.46■■□□□ 1.19
USP18-201ENST00000215794 CDC45O75419 566 aa22.45■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.45■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 PIGBQ92521 554 aa22.45■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.45■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.44■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 KCNQ2O43526 872 aa22.44■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.44■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 ZNF790Q6PG37 636 aa22.43■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.43■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.43■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 ATP8B2P98198 1209 aa22.42■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.42■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.42■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.42■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 SDSP20132 328 aa22.4■■□□□ 1.18
USP18-201ENST00000215794 PROSER3Q2NL68 480 aa22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms