RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000024004.8

Ccl25-201, Transcript of C-C motif chemokine 25, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccl25, Length 1,058 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Pik3r2O08908 722 aa14.8□□□□□ -0.04
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Msx1P13297 303 aa14.8□□□□□ -0.04
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Nubp1Q9R060 320 aa14.8□□□□□ -0.04
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa14.79□□□□□ -0.04
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Fan1Q69ZT1 1020 aa14.79□□□□□ -0.04
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Emilin2Q8K482 1074 aa14.79□□□□□ -0.04
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa14.78□□□□□ -0.04
Ccl25-201ENSMUST00000024004 JundP15066 341 aa14.77□□□□□ -0.05
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa14.77□□□□□ -0.05
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Tmem2Q5FWI3 1383 aa14.76□□□□□ -0.05
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Wnk3Q80XP9 1757 aa14.76□□□□□ -0.05
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Zbtb42Q811H0 420 aa14.76□□□□□ -0.05
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Lrrc7Q80TE7 1490 aa14.76□□□□□ -0.05
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Ccl25-201ENSMUST00000024004 XdhQ00519 1335 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Usp32F8VPZ3 1604 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Gm20521D3Z5F7 333 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Epb42P49222 691 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Os9Q8K2C7 672 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Cep170bQ80U49 1574 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Camta1A2A891 1682 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Usp47Q8BY87 1376 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Ccdc61Q3UJV1 511 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Rgl3Q3UYI5 709 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccl25-201ENSMUST00000024004 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Fam135bQ9DAI6 1403 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Atp7bQ64446 1462 aa14.72□□□□□ -0.05
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Tex14Q7M6U3 1450 aa14.72□□□□□ -0.05
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Galnt6Q8C7U7 622 aa14.72□□□□□ -0.05
Ccl25-201ENSMUST00000024004 DgkhD3YXJ0 1156 aa14.71□□□□□ -0.05
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Idi1P58044 227 aa14.71□□□□□ -0.05
Ccl25-201ENSMUST00000024004 IqubQ8CDK3 788 aa14.71□□□□□ -0.05
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Ccl25-201ENSMUST00000024004 C5P06684 1680 aa14.71□□□□□ -0.06
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Als2Q920R0 1651 aa14.71□□□□□ -0.06
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Atp10bB1AWN4 1474 aa14.7□□□□□ -0.06
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Ptk2P34152 1090 aa14.69□□□□□ -0.06
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Agbl2Q8CDK2 862 aa14.69□□□□□ -0.06
Ccl25-201ENSMUST00000024004 LrgukQ9D5S7 820 aa14.69□□□□□ -0.06
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa14.69□□□□□ -0.06
Ccl25-201ENSMUST00000024004 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Kif1aP33173 1695 aa14.68□□□□□ -0.06
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Mdm2P23804 489 aa14.68□□□□□ -0.06
Ccl25-201ENSMUST00000024004 PtgdrP70263 357 aa14.68□□□□□ -0.06
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Hcn4O70507 1186 aa14.67□□□□□ -0.06
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Rc3h1Q4VGL6 1130 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Smim5Q8BT42 78 aa14.67□□□□□ -0.06
Ccl25-201ENSMUST00000024004 GmprQ9DCZ1 345 aa14.67□□□□□ -0.06
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Ppfia1B2RXQ2 1266 aa14.66□□□□□ -0.06
Ccl25-201ENSMUST00000024004 InhbeO08717 350 aa14.66□□□□□ -0.06
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Wdr17E9Q271 1322 aa14.66□□□□□ -0.06
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Irs1P35569 1233 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Spns2Q91VM4 549 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Fam174aQ9D3L0 190 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Ap3b2Q9JME5 1082 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Krtap10-4Q08EG8 221 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Tigd5Q499M4 642 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Usp40Q8BWR4 1235 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Znf330Q922H9 316 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Armc3A2AU72 881 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Recql4Q75NR7 1216 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Ccl25-201ENSMUST00000024004 SrfQ9JM73 504 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Polr3aB2RXC6 1390 aa14.61□□□□□ -0.07
Ccl25-201ENSMUST00000024004 TprnA2AI08 749 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Rhox1B1APN4 224 aa14.61□□□□□ -0.07
Ccl25-201ENSMUST00000024004 MetrnlQ8VE43 311 aa14.61□□□□□ -0.07
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Rgs17Q9QZB0 210 aa14.61□□□□□ -0.07
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Rasa1E9PYG6 1038 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccl25-201ENSMUST00000024004 ArafP04627 604 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Eid3Q3V124 375 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Stard8Q8K031 1019 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Acsbg1Q99PU5 721 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccl25-201ENSMUST00000024004 PtpruB1AUH1 1446 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Zfand3Q497H0 227 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Col22a1E9Q7P1 1613 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Abca14E9Q8F8 1683 aa14.58□□□□□ -0.07
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Nphp4P59240 1425 aa14.58□□□□□ -0.07
Ccl25-201ENSMUST00000024004 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa14.58□□□□□ -0.08
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Prss12O08762 761 aa14.58□□□□□ -0.08
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Dixdc1Q80Y83 711 aa14.58□□□□□ -0.08
Ccl25-201ENSMUST00000024004 NgefQ8CHT1 710 aa14.58□□□□□ -0.08
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Nfx1B1AY10 1114 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Ccl25-201ENSMUST00000024004 ZgpatQ8VDM1 511 aa14.57□□□□□ -0.08
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Zmym3Q9JLM4 1370 aa14.57□□□□□ -0.08
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Gm3250E9Q1M3 230 aa14.56□□□□□ -0.08
Ccl25-201ENSMUST00000024004 NppbP40753 121 aa14.56□□□□□ -0.08
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Cdk19Q8BWD8 501 aa14.56□□□□□ -0.08
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Eno4Q8C042 619 aa14.56□□□□□ -0.08
Ccl25-201ENSMUST00000024004 Kat6aQ8BZ21 2003 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 87.5 ms