RNA–Protein interactions for RNA: YOR264W

DSE3, Transcript of Daughter cell-specific protein, may help establish daughter fate, yeast

Gene DSE3, Length 1,293 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSE3	YOR264W	GNT1	Q12096	491 aa		7.68	□□□□□ -1.18
DSE3	YOR264W	YPL066W	Q12194	479 aa		7.68	□□□□□ -1.18
DSE3	YOR264W	YLR122C	Q12312	125 aa		7.68	□□□□□ -1.18
DSE3	YOR264W	RAD4	P14736	754 aa		7.67	□□□□□ -1.18
DSE3	YOR264W	KAE1	P36132	386 aa		7.67	□□□□□ -1.18
DSE3	YOR264W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	7.67	□□□□□ -1.18
DSE3	YOR264W	YER152C	P10356	443 aa		7.66	□□□□□ -1.18
DSE3	YOR264W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.66	□□□□□ -1.18	not detected
DSE3	YOR264W	VBA5	P36172	582 aa		7.66	□□□□□ -1.18
DSE3	YOR264W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	7.66	□□□□□ -1.18
DSE3	YOR264W	SHE9	Q04172	456 aa		7.66	□□□□□ -1.18
DSE3	YOR264W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	7.66	□□□□□ -1.18
DSE3	YOR264W	NSI1	Q12457	570 aa		7.66	□□□□□ -1.18
DSE3	YOR264W	YTA7	P40340	1379 aa		7.66	□□□□□ -1.18
DSE3	YOR264W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	7.65	□□□□□ -1.18
DSE3	YOR264W	MRP8	P35719	219 aa		7.65	□□□□□ -1.18
DSE3	YOR264W	YHL012W	P38709	493 aa		7.65	□□□□□ -1.18
DSE3	YOR264W	TIM54	P47045	478 aa		7.65	□□□□□ -1.18
DSE3	YOR264W	RCM1	P53972	490 aa		7.65	□□□□□ -1.18
DSE3	YOR264W	YVC1	Q12324	675 aa		7.65	□□□□□ -1.18
DSE3	YOR264W	COQ4	O13525	335 aa		7.64	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	7.64	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	YSC84	P32793	468 aa		7.64	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	YGR130C	P53278	816 aa		7.64	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	YBR184W	P38299	523 aa		7.63	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	IOC3	P43596	787 aa		7.63	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	7.63	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	TNA1	P53322	534 aa		7.63	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	7.63	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	TAT2	P38967	592 aa		7.62	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	MBP1	P39678	833 aa		7.62	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	IRR1	P40541	1150 aa		7.62	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	NSE3	Q05541	303 aa		7.62	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	STE5	P32917	917 aa		7.61	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	PBY1	P38254	753 aa		7.61	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	CCZ1	P38273	704 aa		7.61	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	BDF2	Q07442	638 aa		7.61	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	SPO75	Q07798	868 aa		7.61	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.6	□□□□□ -1.19	not detected
DSE3	YOR264W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	OSH2	Q12451	1283 aa		7.6	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	YOR131C	Q12486	218 aa		7.6	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	MXR1	P40029	184 aa		7.59	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	HUL5	P53119	910 aa		7.59	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	TRE1	Q08919	783 aa		7.59	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
DSE3	YOR264W	CYC7	P00045	113 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	MDL2	P33311	773 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	YFL054C	P43549	646 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.58	□□□□□ -1.2	not detected
DSE3	YOR264W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	SAM35	P14693	329 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	PNT1	P38969	423 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	MTC5	Q03897	1148 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	ACM1	Q08981	209 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	PRO1	P32264	428 aa		7.56	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	ERP6	P53198	216 aa		7.56	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	YGR125W	P53273	1036 aa		7.56	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	EAF1	Q06337	982 aa		7.56	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	FMP25	Q08023	583 aa		7.56	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	MED7	Q08278	222 aa		7.56	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	RSB1	Q08417	382 aa		7.56	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	TRP3	P00937	484 aa		7.55	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	SNF5	P18480	905 aa		7.55	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	UGA2	P38067	497 aa		7.55	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	PTC7	P38797	343 aa		7.55	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	PIK1	P39104	1066 aa		7.55	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	GTS1	P40956	396 aa		7.55	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	ARE1	P25628	610 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	AIM26	P32858	118 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	BAP2	P38084	609 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	TOS1	P38288	455 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	PEX7	P39108	375 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	ALR2	P43553	858 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	PFD1	P46988	109 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	TPO2	P53283	614 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	YDR306C	Q06640	478 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	YKR073C	P36153	106 aa		7.53	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	GEM1	P39722	662 aa		7.53	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	SSY1	Q03770	852 aa		7.53	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	FLC1	Q08967	793 aa		7.53	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	AIM44	Q99299	758 aa		7.53	□□□□□ -1.2
DSE3	YOR264W	ADP1	P25371	1049 aa		7.52	□□□□□ -1.21
DSE3	YOR264W	PPH3	P32345	308 aa		7.52	□□□□□ -1.21

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