RNA–Protein interactions for RNA: YOR163W

DDP1, Transcript of Polyphosphate phosphatase, yeast

Gene DDP1, Length 567 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDP1	YOR163W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
DDP1	YOR163W	SEC6	P32844	805 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DDP1	YOR163W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
DDP1	YOR163W	TOD6	P34219	525 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DDP1	YOR163W	EXO5	P38289	585 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DDP1	YOR163W	UBP12	P39538	1254 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DDP1	YOR163W	ERP2	P39704	215 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DDP1	YOR163W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
DDP1	YOR163W	DNM1	P54861	757 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DDP1	YOR163W	SAM35	P14693	329 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	CLN2	P20438	545 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	SLS1	P42900	643 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	YGL081W	P53156	320 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	CWC24	P53769	259 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	YKL077W	P36081	392 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	NEM1	P38757	446 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	NUP82	P40368	713 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	HUL5	P53119	910 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	TIM23	P32897	222 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	FUI1	P38196	639 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	YHL012W	P38709	493 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	YAR028W	P39548	234 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	SNO2	P53823	222 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	MDL2	P33311	773 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	MNN4	P36044	1178 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	SHU2	P38957	223 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	MON1	P53129	644 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	SRM1	P21827	482 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	DAK2	P43550	591 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	FOL1	P53848	824 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	PHO8	P11491	566 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	RAD27	P26793	382 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	PET112	P33893	541 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	TAT2	P38967	592 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	RMD1	Q03441	430 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	PPM2	Q08282	695 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DDP1	YOR163W	YLR358C	O13565	187 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	RAD2	P07276	1031 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	RAD4	P14736	754 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	PRI2	P20457	528 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	TIM54	P47045	478 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	COG4	Q06096	861 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	NKP1	Q12493	238 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
DDP1	YOR163W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	CTS1	P29029	562 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	HSE1	P38753	452 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	ENT2	Q05785	613 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	THI4	P32318	326 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	TOA1	P32773	286 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	CYC8	P14922	966 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	AIM26	P32858	118 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	MNR2	P35724	969 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	ENV11	P53246	860 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	PEX8	P53248	589 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	YCS4	Q06156	1176 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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