RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W IRA2P19158 3079 aa10.63□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W MSD1P15179 658 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W RPL8AP17076 256 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W DRE2P36152 348 aa10.62□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W PSP2P50109 593 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W OXR1Q08952 273 aa10.62□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W RIM20Q12033 661 aa10.62□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W POL3P15436 1097 aa10.61□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W SYN8P31377 255 aa10.61□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W PAN5P38787 379 aa10.61□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data10.61□□□□□ -0.71not detected
YLR349WYLR349W DSE3Q08729 430 aa10.61□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W FMP27Q06179 2628 aa10.61□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W PWP2P25635 923 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W SUV3P32580 737 aa10.6□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W STB5P38699 743 aa10.6□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W WHI4Q07655 649 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W RAD59Q12223 238 aa10.6□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W YOR111WQ99210 232 aa10.6□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W SEC20P28791 383 aa10.59□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W MSS51P32335 436 aa10.59□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W IMP2'P32351 346 aa10.59□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W TVP38P36164 337 aa10.59□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W TPM2P40414 161 aa10.59□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W ASE1P50275 885 aa10.59□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W SPO71Q03868 1245 aa10.59□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W SES1P07284 462 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W PPZ1P26570 692 aa10.58□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W CLB5P30283 435 aa10.58□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W SUL1P38359 859 aa10.58□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W HUL5P53119 910 aa10.58□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W SVF1Q05515 481 aa10.58□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W NKP2Q06162 153 aa10.58□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W ARP6Q12509 438 aa10.58□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W YLR422WQ06409 1932 aa10.57□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W SIS1P25294 352 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W SLX1P38324 304 aa10.57□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W HMF1P40037 129 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W PGA3Q12746 312 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W KEX2P13134 814 aa10.56□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W DID4P36108 232 aa10.56□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W ART5P53244 586 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W MUK1Q02866 612 aa10.56□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W YLR455WQ06188 304 aa10.56□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W MMR1Q06324 491 aa10.56□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W CCH1P50077 2039 aa10.55□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W MBR1P23493 339 aa10.55□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W UBP11P36026 717 aa10.55□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W AAP1P37898 856 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W APN2P38207 520 aa10.55□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W YEL025CP39991 1188 aa10.55□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W YTA12P40341 825 aa10.55□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W ALG2P43636 503 aa10.55□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W ISW1P38144 1129 aa10.54□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W CIC1P38779 376 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W GCV2P49095 1034 aa10.54□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W CIT1P00890 479 aa10.53□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W UBC1P21734 215 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W RIM101P33400 625 aa10.53□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W HUL4P40985 892 aa10.53□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W PIG1Q06216 648 aa10.53□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W CRD1Q07560 283 aa10.53□□□□□ -0.72
YLR349WYLR349W RNR3P21672 869 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W ADK2P26364 225 aa10.52□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W APM2P38700 605 aa10.52□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W MDR1P53258 950 aa10.52□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W ORC4P54791 529 aa10.52□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W EST2Q06163 884 aa10.52□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W SGO1Q08490 590 aa10.52□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data10.51□□□□□ -0.73not detected
YLR349WYLR349W ESS1P22696 170 aa10.51□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W RME1P32338 300 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W RFS1P38234 210 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W YFL052WP43551 465 aa10.51□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W ACF4P47129 309 aa10.51□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W YGR273CP53329 174 aa10.51□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W IRC10Q08118 586 aa10.51□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W VAS1P07806 1104 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W CDC48P25694 835 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W PRS1P32895 427 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W BUD16P39988 312 aa10.49□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W MGA2P40578 1113 aa10.49□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W GDE1Q02979 1223 aa10.49□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W NCR1Q12200 1170 aa10.49□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W CAN1P04817 590 aa10.48□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W IMG2P25642 146 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W COQ8P27697 501 aa10.48□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W PEP3P27801 918 aa10.48□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W CCC2P38995 1004 aa10.48□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W ZPR1P53303 486 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W OYE2Q03558 400 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W MET6P05694 767 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
YLR349WYLR349W UBX7P38349 436 aa10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 61.4 ms