RNA–Protein interactions for RNA: YJR084W

YJR084W, Transcript of Protein that forms a complex with Thp3p, yeast

Gene YJR084W, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJR084W	YJR084W	PBY1	P38254	753 aa		7.43	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	TIM50	Q02776	476 aa		7.43	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	INM2	Q05533	292 aa		7.43	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		7.43	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	RPB10	P22139	70 aa		7.42	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	YHL050C	P38721	697 aa		7.42	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	YHR219W	P38900	624 aa		7.42	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	YIR042C	P40586	236 aa		7.42	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	ACF4	P47129	309 aa		7.42	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	RMD1	Q03441	430 aa		7.42	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	GAS5	Q08193	484 aa		7.42	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	KAP122	P32767	1081 aa		7.41	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	MDL2	P33311	773 aa		7.41	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	LDH1	P38139	375 aa		7.41	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	DYS1	P38791	387 aa		7.4	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	FET4	P40988	552 aa		7.4	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	MRPS35	P53292	345 aa		7.4	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	TOS4	Q06266	489 aa		7.4	□□□□□ -1.22
YJR084W	YJR084W	RPC31	P17890	251 aa		7.39	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	OPI1	P21957	404 aa		7.39	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	SPR3	P41901	512 aa		7.39	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	IOC3	P43596	787 aa		7.39	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	IRC8	P47046	822 aa		7.39	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	PIP2	P52960	996 aa		7.39	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	RIM20	Q12033	661 aa		7.39	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	YLR278C	Q05854	1341 aa		7.38	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	HXT8	P40886	569 aa		7.38	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	YGR117C	P53270	476 aa		7.38	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	APC11	Q12157	165 aa		7.38	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	VPS4	P52917	437 aa		7.37	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	NUT2	Q06213	157 aa		7.37	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	TAH18	Q12181	623 aa		7.37	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	STB3	Q12427	513 aa		7.37	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	SNF3	P10870	884 aa		7.36	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	SEC20	P28791	383 aa		7.36	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	MRPL16	P38064	232 aa		7.36	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	GRX7	P38068	203 aa		7.36	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	BRN1	P38170	754 aa		7.36	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	FIR1	P40020	876 aa		7.36	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	ROG3	P43602	733 aa		7.36	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	PIB2	P53191	635 aa		7.36	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	FRT1	Q99332	602 aa		7.36	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	FLO11	P08640	1367 aa		7.35	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	MET1	P36150	593 aa		7.35	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	STV1	P37296	890 aa		7.35	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	CAF120	P53836	1060 aa		7.35	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	TRS120	Q04183	1289 aa		7.35	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	RGP1	P16664	663 aa		7.34	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		7.34	□□□□□ -1.23
YJR084W	YJR084W	CBP1	P07252	654 aa		7.33	□□□□□ -1.24
YJR084W	YJR084W	MSN1	P22148	382 aa		7.33	□□□□□ -1.24
YJR084W	YJR084W	SMC1	P32908	1225 aa		7.33	□□□□□ -1.24
YJR084W	YJR084W	KTR2	P33550	425 aa		7.33	□□□□□ -1.24
YJR084W	YJR084W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.33	□□□□□ -1.24	not detected
YJR084W	YJR084W	BSD2	P38356	321 aa		7.33	□□□□□ -1.24
YJR084W	YJR084W	PEA2	P40091	420 aa		7.33	□□□□□ -1.24
YJR084W	YJR084W	YIR007W	P40566	764 aa		7.33	□□□□□ -1.24
YJR084W	YJR084W	UFD2	P54860	961 aa		7.33	□□□□□ -1.24
YJR084W	YJR084W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
YJR084W	YJR084W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
YJR084W	YJR084W	YPL260W	Q08977	551 aa		7.33	□□□□□ -1.24
YJR084W	YJR084W	GIP1	P38229	639 aa		7.32	□□□□□ -1.24
YJR084W	YJR084W	RTS1	P38903	757 aa		7.32	□□□□□ -1.24
YJR084W	YJR084W	MTC3	P53077	123 aa		7.32	□□□□□ -1.24
YJR084W	YJR084W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
YJR084W	YJR084W	PCL8	Q08966	492 aa		7.32	□□□□□ -1.24
YJR084W	YJR084W	YDL176W	Q12027	708 aa		7.32	□□□□□ -1.24
YJR084W	YJR084W	LAM4	P38800	1345 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YJR084W	YJR084W	HEM3	P28789	327 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YJR084W	YJR084W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.31	□□□□□ -1.24	not detected
YJR084W	YJR084W	ISW1	P38144	1129 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YJR084W	YJR084W	RAD55	P38953	406 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YJR084W	YJR084W	NIT1	P40447	199 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YJR084W	YJR084W	CUZ1	P53899	274 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YJR084W	YJR084W	YOR296W	Q08748	1289 aa		7.31	□□□□□ -1.24

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 37.4 ms