RNA–Protein interactions for RNA: YHR199C-A

NBL1, Transcript of Subunit of the conserved chromosomal passenger complex (CPC), yeast

Gene NBL1, Length 222 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NBL1	YHR199C-A	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.18	□□□□□ -1.74	not detected
NBL1	YHR199C-A	SPO21	Q12411	609 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NBL1	YHR199C-A	COQ4	O13525	335 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NBL1	YHR199C-A	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
NBL1	YHR199C-A	THI80	P35202	319 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NBL1	YHR199C-A	RGD1	P38339	666 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NBL1	YHR199C-A	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
NBL1	YHR199C-A	MRPL22	P53881	309 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NBL1	YHR199C-A	RMD1	Q03441	430 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NBL1	YHR199C-A	RTT10	Q08924	1013 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NBL1	YHR199C-A	MLS1	P30952	554 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NBL1	YHR199C-A	RER2	P35196	286 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NBL1	YHR199C-A	PIK1	P39104	1066 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NBL1	YHR199C-A	CNN1	P43618	361 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NBL1	YHR199C-A	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
NBL1	YHR199C-A	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
NBL1	YHR199C-A	SPS1	P08458	490 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	YER152C	P10356	443 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	RAD27	P26793	382 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	DUT1	P33317	147 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	CCZ1	P38273	704 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	MPH1	P40562	993 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	YFL054C	P43549	646 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	RSB1	Q08417	382 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
NBL1	YHR199C-A	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	SNO2	P53823	222 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	CDC34	P14682	295 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	RIM8	P53179	542 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	ENV11	P53246	860 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	EEB1	Q02891	456 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	YPL277C	Q08989	487 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	SOD2	P00447	233 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	PET112	P33893	541 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	HNT2	P49775	206 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
NBL1	YHR199C-A	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	LYP1	P32487	611 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	MNR2	P35724	969 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	MCM7	P38132	845 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	MET10	P39692	1035 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	MXR1	P40029	184 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	TAF1	P46677	1066 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	ESC8	Q08119	714 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	BAS1	P22035	811 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	YCR015C	P25616	317 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	LAM1	P38851	1228 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	YDR132C	Q03900	495 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	SGD1	Q06132	899 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	GNT1	Q12096	491 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NBL1	YHR199C-A	SRM1	P21827	482 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	TOD6	P34219	525 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	FLR1	P38124	548 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	RFC5	P38251	354 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	PNT1	P38969	423 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	MEF2	P39677	819 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	TYW3	P53177	273 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	PLB2	Q03674	706 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	RSM24	Q03976	319 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	ATG13	Q06628	738 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	YPL066W	Q12194	479 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	SVS1	Q12254	260 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	INO1	P11986	533 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	UGA2	P38067	497 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	YGR053C	P53234	283 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.07	□□□□□ -1.76	not detected
NBL1	YHR199C-A	ROT1	Q03691	256 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	GAL10	P04397	699 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	SLA2	P33338	968 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	GEM1	P39722	662 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	GIP4	P39732	760 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	GCN5	Q03330	439 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	DUS4	Q06063	367 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	YOR352W	Q08816	343 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	ACM1	Q08981	209 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	BI4	P03879	638 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	CMP2	P14747	604 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	ACE2	P21192	770 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	not detected
NBL1	YHR199C-A	APL1	P27351	700 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	YKL222C	P35995	705 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	YGL176C	P46945	554 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NBL1	YHR199C-A	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76

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