RNA–Protein interactions for RNA: YHR160C

PEX18, Transcript of Peroxin, yeast

Gene PEX18, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX18	YHR160C	MLS1	P30952	554 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	BAP2	P38084	609 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	ENT3	P47160	408 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	TNA1	P53322	534 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	MRPL22	P53881	309 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	YPL260W	Q08977	551 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	YER152C	P10356	443 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	SNF5	P18480	905 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	RER2	P35196	286 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	RTT10	Q08924	1013 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	SPS1	P08458	490 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	CCZ1	P38273	704 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	RGD1	P38339	666 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	CNN1	P43618	361 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	RAD27	P26793	382 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	DUT1	P33317	147 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	RMD1	Q03441	430 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	THI80	P35202	319 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	PIK1	P39104	1066 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	MPH1	P40562	993 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	RSB1	Q08417	382 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.47	□□□□□ -1.53	not detected
PEX18	YHR160C	PET112	P33893	541 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	MCM7	P38132	845 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PEX18	YHR160C	CDC34	P14682	295 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	EEB1	Q02891	456 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	MXR1	P40029	184 aa		5.45	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	SNO2	P53823	222 aa		5.45	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.45	□□□□□ -1.54	not detected
PEX18	YHR160C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	YPL277C	Q08989	487 aa		5.44	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	LYP1	P32487	611 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	HNT2	P49775	206 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	BAS1	P22035	811 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	TAF1	P46677	1066 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	TYW3	P53177	273 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	RIM8	P53179	542 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.42	□□□□□ -1.54	not detected
PEX18	YHR160C	GNT1	Q12096	491 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	YPL066W	Q12194	479 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	INO1	P11986	533 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	TOD6	P34219	525 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	MET10	P39692	1035 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	ROT1	Q03691	256 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	ESC8	Q08119	714 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	SVS1	Q12254	260 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	SOD2	P00447	233 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	SRM1	P21827	482 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	MNR2	P35724	969 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	RFC5	P38251	354 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	PLB2	Q03674	706 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	SGD1	Q06132	899 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
PEX18	YHR160C	CMP2	P14747	604 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	UGA2	P38067	497 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	FLR1	P38124	548 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	LAM1	P38851	1228 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	ENV11	P53246	860 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	ESC2	Q06340	456 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	BI4	P03879	638 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	GAL10	P04397	699 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	YCR015C	P25616	317 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	PNT1	P38969	423 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	MEF2	P39677	819 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	YGL176C	P46945	554 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	YDR132C	Q03900	495 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	RSM24	Q03976	319 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	YOR352W	Q08816	343 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	ACM1	Q08981	209 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	APL1	P27351	700 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	SLA2	P33338	968 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	YKL222C	P35995	705 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	YGR053C	P53234	283 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.37	□□□□□ -1.55	not detected
PEX18	YHR160C	GIP4	P39732	760 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	SPT20	P50875	604 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	GDE1	Q02979	1223 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	GCN5	Q03330	439 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	ACE2	P21192	770 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PEX18	YHR160C	GEM1	P39722	662 aa		5.35	□□□□□ -1.55

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