RNA–Protein interactions for RNA: YFR056C

YFR056C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YFR056C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YFR056CYFR056C PIK1P39104 1066 aa3.64□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C SEC26P41810 973 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C HNT2P49775 206 aa3.64□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C SIW14P53965 281 aa3.64□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C ROD1Q02805 837 aa3.64□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C YPL277CQ08989 487 aa3.64□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C MKK2P32491 506 aa3.63□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C PEP7P32609 515 aa3.63□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C BAP2P38084 609 aa3.63□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C RPN3P40016 523 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C TAF1P46677 1066 aa3.63□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C ENT3P47160 408 aa3.63□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C SYP1P25623 870 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C RAD27P26793 382 aa3.62□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C FLR1P38124 548 aa3.62□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C RGD1P38339 666 aa3.62□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C RSM24Q03976 319 aa3.62□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C SGD1Q06132 899 aa3.62□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C YLR358CO13565 187 aa3.61□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C CYC1P00044 109 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C MCM2P29469 868 aa3.61□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C RFC5P38251 354 aa3.61□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C LAM1P38851 1228 aa3.61□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C CNN1P43618 361 aa3.61□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C SPT20P50875 604 aa3.61□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C SPR28Q04921 423 aa3.61□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C GCR1P07261 785 aa3.6□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C SNF5P18480 905 aa3.6□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C HEM3P28789 327 aa3.6□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C MLS1P30952 554 aa3.6□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C ROT1Q03691 256 aa3.6□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C ESF1Q06344 628 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C KIN2P13186 1147 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C ATE1P16639 503 aa3.59□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C ASF1P32447 279 aa3.59□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C MCM7P38132 845 aa3.59□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C MEF2P39677 819 aa3.59□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C YJR107WP47145 328 aa3.59□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C SVS1Q12254 260 aa3.59□□□□□ -1.83
YFR056CYFR056C YER152CP10356 443 aa3.58□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C CMP2P14747 604 aa3.58□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C DBP5P20449 482 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C HXT13P39924 564 aa3.58□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C FYV10P40492 516 aa3.58□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C PBP1P53297 722 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C HXT17P53631 564 aa3.58□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C HXT15P54854 567 aa3.58□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C GCN5Q03330 439 aa3.58□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C RTT10Q08924 1013 aa3.58□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C TMA46Q12000 345 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data3.57□□□□□ -1.84not detected
YFR056CYFR056C APL1P27351 700 aa3.57□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C GNP1P48813 663 aa3.57□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data3.57□□□□□ -1.84not detected
YFR056CYFR056C GAL10P04397 699 aa3.56□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C BAS1P22035 811 aa3.56□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C SHM2P37291 469 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data3.56□□□□□ -1.84not detected
YFR056CYFR056C YFL054CP43549 646 aa3.56□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C YDR132CQ03900 495 aa3.56□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C RXT3Q07458 294 aa3.56□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C RER2P35196 286 aa3.55□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C TAT2P38967 592 aa3.55□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C MPH1P40562 993 aa3.55□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C RMD1Q03441 430 aa3.55□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C OYE2Q03558 400 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C TIF35Q04067 274 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C GSF2Q04697 403 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data3.55□□□□□ -1.84not detected
YFR056CYFR056C GNT1Q12096 491 aa3.55□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C THS1P04801 734 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C PET112P33893 541 aa3.54□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C UGA2P38067 497 aa3.54□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C MXR1P40029 184 aa3.54□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C PLB2Q03674 706 aa3.54□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C GPB1Q08886 897 aa3.54□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C ACM1Q08981 209 aa3.54□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C TUB2P02557 457 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C CTS1P29029 562 aa3.53□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C DOM34P33309 386 aa3.53□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C GEM1P39722 662 aa3.53□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C GTF1P53260 183 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C DUS4Q06063 367 aa3.53□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
YFR056CYFR056C ACE2P21192 770 aa3.52□□□□□ -1.85
YFR056CYFR056C LYP1P32487 611 aa3.52□□□□□ -1.85
YFR056CYFR056C SNF7P39929 240 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
YFR056CYFR056C RRT14P40470 206 aa3.52□□□□□ -1.85
YFR056CYFR056C GIS1Q03833 894 aa3.52□□□□□ -1.85
YFR056CYFR056C ATG13Q06628 738 aa3.52□□□□□ -1.85
YFR056CYFR056C TRP2P00899 507 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
YFR056CYFR056C SRM1P21827 482 aa3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.2 ms