RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

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Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 AK7Q96M32 723 aa29.87■■■□□ 2.37
SYT6-210ENST00000641643 RSPH6AQ9H0K4 717 aa29.87■■■□□ 2.37
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SYT6-210ENST00000641643 SLC16A10Q8TF71 515 aa29.86■■■□□ 2.37
SYT6-210ENST00000641643 LGR6Q9HBX8 967 aa29.86■■■□□ 2.37
SYT6-210ENST00000641643 MSH5O43196 834 aa29.86■■■□□ 2.37
SYT6-210ENST00000641643 C5P01031 1676 aa29.86■■■□□ 2.37
SYT6-210ENST00000641643 FCHSD2O94868 740 aa29.85■■■□□ 2.37
SYT6-210ENST00000641643 SLC52A2Q9HAB3 445 aa29.85■■■□□ 2.37
SYT6-210ENST00000641643 FLAD1Q8NFF5 587 aa29.83■■■□□ 2.37
SYT6-210ENST00000641643 GNAT3A8MTJ3 354 aa29.82■■■□□ 2.36
SYT6-210ENST00000641643 PTGER2P43116 358 aa29.82■■■□□ 2.36
SYT6-210ENST00000641643 LINC00116Q8NCU8 138 aa29.82■■■□□ 2.36
SYT6-210ENST00000641643 SCN11AQ9UI33 1791 aa29.82■■■□□ 2.36
SYT6-210ENST00000641643 ITPK1Q13572 414 aa29.81■■■□□ 2.36
SYT6-210ENST00000641643 PHACTR3Q96KR7 559 aa29.81■■■□□ 2.36
SYT6-210ENST00000641643 QSER1Q2KHR3 1735 aa29.81■■■□□ 2.36
SYT6-210ENST00000641643 MAP3K5Q99683 1374 aa29.81■■■□□ 2.36
SYT6-210ENST00000641643 TAF1LQ8IZX4 1826 aa29.8■■■□□ 2.36
SYT6-210ENST00000641643 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
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SYT6-210ENST00000641643 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
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SYT6-210ENST00000641643 POLD1P28340 1107 aa29.77■■■□□ 2.36
SYT6-210ENST00000641643 TEFQ10587 303 aa29.77■■■□□ 2.36
SYT6-210ENST00000641643 SLC4A9Q96Q91 983 aa29.77■■■□□ 2.36
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SYT6-210ENST00000641643 PHF14O94880 888 aa29.76■■■□□ 2.35
SYT6-210ENST00000641643 SGIP1Q9BQI5 828 aa29.75■■■□□ 2.35
SYT6-210ENST00000641643 IL17REQ8NFR9 667 aa29.74■■■□□ 2.35
SYT6-210ENST00000641643 MRC1P22897 1456 aa29.74■■■□□ 2.35
SYT6-210ENST00000641643 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
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SYT6-210ENST00000641643 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
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SYT6-210ENST00000641643 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
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SYT6-210ENST00000641643 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
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SYT6-210ENST00000641643 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
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SYT6-210ENST00000641643 VSIG10Q8N0Z9 540 aa29.62■■■□□ 2.33
SYT6-210ENST00000641643 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
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SYT6-210ENST00000641643 STARD3NLO95772 234 aa29.56■■■□□ 2.32
SYT6-210ENST00000641643 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
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SYT6-210ENST00000641643 RIPK4P57078 832 aa29.49■■■□□ 2.31
SYT6-210ENST00000641643 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa29.49■■■□□ 2.31
SYT6-210ENST00000641643 CCDC146Q8IYE0 955 aa29.48■■■□□ 2.31
SYT6-210ENST00000641643 ADAMTS8Q9UP79 889 aa29.47■■■□□ 2.31
SYT6-210ENST00000641643 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
SYT6-210ENST00000641643 ZPR1O75312 459 aa29.47■■■□□ 2.31
SYT6-210ENST00000641643 MMP10P09238 476 aa29.47■■■□□ 2.31
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