RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639221.1

SLC35A3-216, Transcript of solute carrier family 35 member A3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC35A3, Length 1,032 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A3-216ENST00000639221 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
SLC35A3-216ENST00000639221 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
SLC35A3-216ENST00000639221 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
SLC35A3-216ENST00000639221 AK7Q96M32 723 aa29.79■■■□□ 2.36
SLC35A3-216ENST00000639221 LGR6Q9HBX8 967 aa29.79■■■□□ 2.36
SLC35A3-216ENST00000639221 LRP5O75197 1615 aa29.78■■■□□ 2.36
SLC35A3-216ENST00000639221 TEFQ10587 303 aa29.78■■■□□ 2.36
SLC35A3-216ENST00000639221 FLAD1Q8NFF5 587 aa29.78■■■□□ 2.36
SLC35A3-216ENST00000639221 PHACTR3Q96KR7 559 aa29.78■■■□□ 2.36
SLC35A3-216ENST00000639221 SLC16A10Q8TF71 515 aa29.76■■■□□ 2.35
SLC35A3-216ENST00000639221 MTFR1LQ9H019 292 aa29.76■■■□□ 2.35
SLC35A3-216ENST00000639221 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
SLC35A3-216ENST00000639221 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.75■■■□□ 2.35
SLC35A3-216ENST00000639221 SCN11AQ9UI33 1791 aa29.75■■■□□ 2.35
SLC35A3-216ENST00000639221 ZBTB7AO95365 584 aa29.75■■■□□ 2.35
SLC35A3-216ENST00000639221 MSH5O43196 834 aa29.74■■■□□ 2.35
SLC35A3-216ENST00000639221 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP29.73■■■□□ 2.35
SLC35A3-216ENST00000639221 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
SLC35A3-216ENST00000639221 C5P01031 1676 aa29.72■■■□□ 2.35
SLC35A3-216ENST00000639221 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
SLC35A3-216ENST00000639221 TTC5Q8N0Z6 440 aa29.71■■■□□ 2.35
SLC35A3-216ENST00000639221 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
SLC35A3-216ENST00000639221 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa29.71■■■□□ 2.35
SLC35A3-216ENST00000639221 MRC1P22897 1456 aa29.7■■■□□ 2.35
SLC35A3-216ENST00000639221 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
SLC35A3-216ENST00000639221 CASZ1Q86V15 1759 aa29.69■■■□□ 2.34
SLC35A3-216ENST00000639221 IL17REQ8NFR9 667 aa29.69■■■□□ 2.34
SLC35A3-216ENST00000639221 ITPK1Q13572 414 aa29.68■■■□□ 2.34
SLC35A3-216ENST00000639221 LINC00116Q8NCU8 138 aa29.68■■■□□ 2.34
SLC35A3-216ENST00000639221 QSER1Q2KHR3 1735 aa29.66■■■□□ 2.34
SLC35A3-216ENST00000639221 ANP32CO43423 234 aa29.66■■■□□ 2.34
SLC35A3-216ENST00000639221 C4BP0C0L5 1744 aa29.65■■■□□ 2.34
SLC35A3-216ENST00000639221 GNPATO15228 680 aa29.65■■■□□ 2.34
SLC35A3-216ENST00000639221 SSFA2P28290 1259 aa29.65■■■□□ 2.34
SLC35A3-216ENST00000639221 POLD1P28340 1107 aa29.65■■■□□ 2.34
SLC35A3-216ENST00000639221 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa29.65■■■□□ 2.34
SLC35A3-216ENST00000639221 TAF1LQ8IZX4 1826 aa29.64■■■□□ 2.34
SLC35A3-216ENST00000639221 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
SLC35A3-216ENST00000639221 PLEKHF1Q96S99 279 aa29.64■■■□□ 2.34
SLC35A3-216ENST00000639221 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa29.64■■■□□ 2.33
SLC35A3-216ENST00000639221 SLC39A6Q13433 755 aa29.63■■■□□ 2.33
SLC35A3-216ENST00000639221 NFE2L2Q16236 605 aa29.63■■■□□ 2.33
SLC35A3-216ENST00000639221 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
SLC35A3-216ENST00000639221 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
SLC35A3-216ENST00000639221 ZNF831Q5JPB2 1677 aa29.63■■■□□ 2.33
SLC35A3-216ENST00000639221 PHF14O94880 888 aa29.62■■■□□ 2.33
SLC35A3-216ENST00000639221 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
SLC35A3-216ENST00000639221 BTBD11A6QL63 1104 aa29.61■■■□□ 2.33
SLC35A3-216ENST00000639221 VSIG10Q8N0Z9 540 aa29.61■■■□□ 2.33
SLC35A3-216ENST00000639221 SLC4A9Q96Q91 983 aa29.61■■■□□ 2.33
SLC35A3-216ENST00000639221 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa29.61■■■□□ 2.33
SLC35A3-216ENST00000639221 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa29.6■■■□□ 2.33
SLC35A3-216ENST00000639221 MCM10Q7L590 875 aa29.6■■■□□ 2.33
SLC35A3-216ENST00000639221 ZNF790Q6PG37 636 aa29.59■■■□□ 2.33
SLC35A3-216ENST00000639221 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
SLC35A3-216ENST00000639221 ADRA2BP18089 450 aa29.58■■■□□ 2.33
SLC35A3-216ENST00000639221 PTGER2P43116 358 aa29.58■■■□□ 2.33
SLC35A3-216ENST00000639221 TRAPPC3LQ5T215 181 aa29.58■■■□□ 2.33
SLC35A3-216ENST00000639221 LMOD3Q0VAK6 560 aa29.57■■■□□ 2.32
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SLC35A3-216ENST00000639221 ARXQ96QS3 562 aa29.56■■■□□ 2.32
SLC35A3-216ENST00000639221 RPS6KA4O75676 772 aa29.55■■■□□ 2.32
SLC35A3-216ENST00000639221 STARD3NLO95772 234 aa29.55■■■□□ 2.32
SLC35A3-216ENST00000639221 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
SLC35A3-216ENST00000639221 RUNDC1Q96C34 613 aa29.55■■■□□ 2.32
SLC35A3-216ENST00000639221 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa29.55■■■□□ 2.32
SLC35A3-216ENST00000639221 CRKLP46109 303 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
SLC35A3-216ENST00000639221 DCTN1Q14203 1278 aa29.54■■■□□ 2.32
SLC35A3-216ENST00000639221 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
SLC35A3-216ENST00000639221 DNAJC10Q8IXB1 793 aa29.54■■■□□ 2.32
SLC35A3-216ENST00000639221 RIPK4P57078 832 aa29.53■■■□□ 2.32
SLC35A3-216ENST00000639221 ADAMTS8Q9UP79 889 aa29.53■■■□□ 2.32
SLC35A3-216ENST00000639221 RFC4P35249 363 aa29.52■■■□□ 2.32
SLC35A3-216ENST00000639221 SGIP1Q9BQI5 828 aa29.52■■■□□ 2.32
SLC35A3-216ENST00000639221 DCAF8L1A6NGE4 600 aa29.51■■■□□ 2.31
SLC35A3-216ENST00000639221 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
SLC35A3-216ENST00000639221 CCDC87Q9NVE4 849 aa29.51■■■□□ 2.31
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SLC35A3-216ENST00000639221 CCDC146Q8IYE0 955 aa29.5■■■□□ 2.31
SLC35A3-216ENST00000639221 UBR3Q6ZT12 1888 aa29.5■■■□□ 2.31
SLC35A3-216ENST00000639221 HEG1Q9ULI3 1381 aa29.5■■■□□ 2.31
SLC35A3-216ENST00000639221 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
SLC35A3-216ENST00000639221 TMPOP42166 694 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
SLC35A3-216ENST00000639221 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
SLC35A3-216ENST00000639221 MSL1Q68DK7 614 aa29.48■■■□□ 2.31
SLC35A3-216ENST00000639221 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
SLC35A3-216ENST00000639221 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
SLC35A3-216ENST00000639221 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
SLC35A3-216ENST00000639221 AMIGO3Q86WK7 504 aa29.47■■■□□ 2.31
SLC35A3-216ENST00000639221 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
SLC35A3-216ENST00000639221 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
SLC35A3-216ENST00000639221 SMIM5Q71RC9 77 aa29.45■■■□□ 2.31
SLC35A3-216ENST00000639221 NLGN1Q8N2Q7 840 aa29.45■■■□□ 2.31
SLC35A3-216ENST00000639221 TJP1Q07157 1748 aa29.45■■■□□ 2.3
SLC35A3-216ENST00000639221 UBR2Q8IWV8 1755 aa29.44■■■□□ 2.3
SLC35A3-216ENST00000639221 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
SLC35A3-216ENST00000639221 NEUROD2Q15784 382 aa29.44■■■□□ 2.3
SLC35A3-216ENST00000639221 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
SLC35A3-216ENST00000639221 MRS2Q9HD23 443 aa29.44■■■□□ 2.3
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