RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
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HCG18-242ENST00000602319 RNF214Q8ND24 703 aa11.99□□□□□ -0.49
HCG18-242ENST00000602319 AOX1Q06278 1338 aa11.99□□□□□ -0.49
HCG18-242ENST00000602319 CHGAP10645 457 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
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HCG18-242ENST00000602319 CDK19Q9BWU1 502 aa11.96□□□□□ -0.49
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HCG18-242ENST00000602319 CABP1Q9NZU7 370 aa11.94□□□□□ -0.5
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HCG18-242ENST00000602319 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP11.91□□□□□ -0.53e-7■■■□□ 16.5
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HCG18-242ENST00000602319 STK26Q9P289 416 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-242ENST00000602319 CTNNA3Q9UI47 895 aa11.89□□□□□ -0.51
HCG18-242ENST00000602319 KCNA4P22459 653 aa11.88□□□□□ -0.51
HCG18-242ENST00000602319 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
HCG18-242ENST00000602319 DIP2AQ14689 1571 aa11.88□□□□□ -0.51
HCG18-242ENST00000602319 STX6O43752 255 aa11.88□□□□□ -0.51
HCG18-242ENST00000602319 GGT6Q6P531 493 aa11.88□□□□□ -0.51
HCG18-242ENST00000602319 ARID3AQ99856 593 aa11.88□□□□□ -0.51
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