RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598840.5

SAE1-209, Transcript of SUMO1 activating enzyme subunit 1, human

TSL 5 BASIC

Gene SAE1, Length 1,831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SAE1-209	ENST00000598840	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
SAE1-209	ENST00000598840	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SAE1-209	ENST00000598840	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SAE1-209	ENST00000598840	KRT24	Q2M2I5	525 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SAE1-209	ENST00000598840	TSPYL6	Q8N831	410 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SAE1-209	ENST00000598840	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
SAE1-209	ENST00000598840	KCNQ3	O43525	872 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SAE1-209	ENST00000598840	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	32.19	■■■□□ 2.74
SAE1-209	ENST00000598840	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	32.19	■■■□□ 2.74
SAE1-209	ENST00000598840	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
SAE1-209	ENST00000598840	MRC1	P22897	1456 aa		32.17	■■■□□ 2.74
SAE1-209	ENST00000598840	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	32.17	■■■□□ 2.74
SAE1-209	ENST00000598840	VAMP4	O75379	141 aa		32.16	■■■□□ 2.74
SAE1-209	ENST00000598840	SLC39A6	Q13433	755 aa		32.16	■■■□□ 2.74
SAE1-209	ENST00000598840	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		32.16	■■■□□ 2.74
SAE1-209	ENST00000598840	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		32.15	■■■□□ 2.74
SAE1-209	ENST00000598840	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
SAE1-209	ENST00000598840	BCAR3	O75815	825 aa		32.14	■■■□□ 2.74
SAE1-209	ENST00000598840	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
SAE1-209	ENST00000598840	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SAE1-209	ENST00000598840	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		32.12	■■■□□ 2.73
SAE1-209	ENST00000598840	ZNF790	Q6PG37	636 aa		32.12	■■■□□ 2.73
SAE1-209	ENST00000598840	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		32.12	■■■□□ 2.73
SAE1-209	ENST00000598840	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SAE1-209	ENST00000598840	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
SAE1-209	ENST00000598840	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
SAE1-209	ENST00000598840	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
SAE1-209	ENST00000598840	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SAE1-209	ENST00000598840	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
SAE1-209	ENST00000598840	PIGB	Q92521	554 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SAE1-209	ENST00000598840	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SAE1-209	ENST00000598840	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SAE1-209	ENST00000598840	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SAE1-209	ENST00000598840	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SAE1-209	ENST00000598840	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
SAE1-209	ENST00000598840	ZNF428	Q96B54	188 aa		32.07	■■■□□ 2.72
SAE1-209	ENST00000598840	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
SAE1-209	ENST00000598840	PLIN1	O60240	522 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SAE1-209	ENST00000598840	FAM182B	Q5T319	152 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SAE1-209	ENST00000598840	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SAE1-209	ENST00000598840	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
SAE1-209	ENST00000598840	RXRB	P28702	533 aa		32.04	■■■□□ 2.72
SAE1-209	ENST00000598840	ITGB4	P16144	1822 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SAE1-209	ENST00000598840	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SAE1-209	ENST00000598840	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
SAE1-209	ENST00000598840	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SAE1-209	ENST00000598840	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
SAE1-209	ENST00000598840	BCL9	O00512	1426 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SAE1-209	ENST00000598840	POTEA	Q6S8J7	498 aa		32.01	■■■□□ 2.72
SAE1-209	ENST00000598840	NECTIN2	Q92692	538 aa		32.01	■■■□□ 2.72
SAE1-209	ENST00000598840	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		32.01	■■■□□ 2.72
SAE1-209	ENST00000598840	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
SAE1-209	ENST00000598840	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		32	■■■□□ 2.71
SAE1-209	ENST00000598840	NEFL	P07196	543 aa		32	■■■□□ 2.71
SAE1-209	ENST00000598840	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
SAE1-209	ENST00000598840	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		32	■■■□□ 2.71
SAE1-209	ENST00000598840	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
SAE1-209	ENST00000598840	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SAE1-209	ENST00000598840	KCNQ2	O43526	872 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SAE1-209	ENST00000598840	ATG3	Q9NT62	314 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SAE1-209	ENST00000598840	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
SAE1-209	ENST00000598840	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
SAE1-209	ENST00000598840	HOXB7	P09629	217 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SAE1-209	ENST00000598840	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
SAE1-209	ENST00000598840	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
SAE1-209	ENST00000598840	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SAE1-209	ENST00000598840	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		31.96	■■■□□ 2.71
SAE1-209	ENST00000598840	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	31.96	■■■□□ 2.71
SAE1-209	ENST00000598840	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		31.96	■■■□□ 2.71
SAE1-209	ENST00000598840	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		31.95	■■■□□ 2.7
SAE1-209	ENST00000598840	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
SAE1-209	ENST00000598840	FKBP8	Q14318	412 aa		31.93	■■■□□ 2.7
SAE1-209	ENST00000598840	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
SAE1-209	ENST00000598840	PAPPA	Q13219	1627 aa		31.93	■■■□□ 2.7
SAE1-209	ENST00000598840	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		31.92	■■■□□ 2.7
SAE1-209	ENST00000598840	SLC4A2	P04920	1241 aa		31.92	■■■□□ 2.7
SAE1-209	ENST00000598840	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	31.91	■■■□□ 2.7
SAE1-209	ENST00000598840	STK31	Q9BXU1	1019 aa		31.91	■■■□□ 2.7
SAE1-209	ENST00000598840	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		31.91	■■■□□ 2.7
SAE1-209	ENST00000598840	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		31.91	■■■□□ 2.7
SAE1-209	ENST00000598840	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	31.91	■■■□□ 2.7
SAE1-209	ENST00000598840	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SAE1-209	ENST00000598840	USP16	Q9Y5T5	823 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SAE1-209	ENST00000598840	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		31.89	■■■□□ 2.7
SAE1-209	ENST00000598840	KIF16B	Q96L93	1317 aa		31.89	■■■□□ 2.7
SAE1-209	ENST00000598840	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		31.89	■■■□□ 2.7
SAE1-209	ENST00000598840	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		31.89	■■■□□ 2.69
SAE1-209	ENST00000598840	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SAE1-209	ENST00000598840	TNN	Q9UQP3	1299 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SAE1-209	ENST00000598840	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	31.86	■■■□□ 2.69
SAE1-209	ENST00000598840	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SAE1-209	ENST00000598840	RGS12	O14924	1447 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SAE1-209	ENST00000598840	C5	P01031	1676 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SAE1-209	ENST00000598840	G2E3	Q7L622	706 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SAE1-209	ENST00000598840	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SAE1-209	ENST00000598840	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SAE1-209	ENST00000598840	ANXA1	P04083	346 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SAE1-209	ENST00000598840	TRIM27	P14373	513 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SAE1-209	ENST00000598840	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SAE1-209	ENST00000598840	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	31.82	■■■□□ 2.68

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