RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548746.5

CS-213, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-213ENST00000548746 PALLDQ8WX93 1383 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-213ENST00000548746 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
CS-213ENST00000548746 PRKAR2BP31323 418 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-213ENST00000548746 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP7.9□□□□□ -1.14
CS-213ENST00000548746 PIGBQ92521 554 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-213ENST00000548746 PHACTR3Q96KR7 559 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-213ENST00000548746 PLEKHF1Q96S99 279 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-213ENST00000548746 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 TMOD3Q9NYL9 352 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 UBR3Q6ZT12 1888 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 KCPQ6ZWJ8 1503 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 RNMTO43148 476 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 RNF39Q9H2S5 420 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 SLC52A2Q9HAB3 445 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 ATG3Q9NT62 314 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 LRRC4BQ9NT99 713 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 C4BP0C0L5 1744 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 TJP1Q07157 1748 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 NBPF14Q5TI25 921 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 AKT1S1Q96B36 256 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 KDM3BQ7LBC6 1761 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 SIK1P57059 783 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 CABP4P57796 275 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 IL17REQ8NFR9 667 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 LGR6Q9HBX8 967 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 ASAP1Q9ULH1 1129 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 ANP32CO43423 234 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 NFE2L2Q16236 605 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 SLC15A2Q16348 729 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 ZNF827Q17R98 1081 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 STK32BQ9NY57 414 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-213ENST00000548746 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 NEFMP07197 916 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 ITPK1Q13572 414 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP7.83□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 CCDC184Q52MB2 194 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 VSIG10Q8N0Z9 540 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 LINC00116Q8NCU8 138 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 RUNDC1Q96C34 613 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 ADAMTS8Q9UP79 889 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 LAMB4A4D0S4 1761 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 C4AP0C0L4 1744 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 TMPOP42166 694 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 KCNQ4P56696 695 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 TEFQ10587 303 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 ZNF790Q6PG37 636 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 HEG1Q9ULI3 1381 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 SSFA2P28290 1259 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 ATP6V1AP38606 617 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 LMOD3Q0VAK6 560 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 MCM10Q7L590 875 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 SLC16A10Q8TF71 515 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 SGIP1Q9BQI5 828 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 BABAM1Q9NWV8 329 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 SLC39A6Q13433 755 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 DCTN1Q14203 1278 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 AMIGO3Q86WK7 504 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 MTFR1LQ9H019 292 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 MRS2Q9HD23 443 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 TRIM35Q9UPQ4 493 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 BTBD11A6QL63 1104 aa7.79□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 PTGER2P43116 358 aa7.79□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 RIPK4P57078 832 aa7.79□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 CCDC27Q2M243 656 aa7.79□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 CCDC146Q8IYE0 955 aa7.79□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 TTC5Q8N0Z6 440 aa7.79□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 AK7Q96M32 723 aa7.79□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa7.79□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 SCN7AQ01118 1682 aa7.79□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
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