RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 MEIS3Q99687 375 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 FAM13BQ9NYF5 915 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 CACNA1FO60840 1977 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 WASLO00401 505 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 MYRIPQ8NFW9 859 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 SIRT1Q96EB6 747 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 A2ML1A8K2U0 1454 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 FAM83GA6ND36 823 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 PLEKHG5O94827 1062 aa12.78□□□□□ -0.36
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CS-202ENST00000542324 TECPR2O15040 1411 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 CRB1P82279 1406 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 STAP2Q9UGK3 403 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 PXDNLA1KZ92 1463 aa12.77□□□□□ -0.36
CS-202ENST00000542324 FBLN1P23142 703 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP12.77□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 PIBF1Q8WXW3 757 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP12.77□□□□□ -0.372e-8■■□□□ 13.3
CS-202ENST00000542324 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 LRRC37A3O60309 1634 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 FMN2Q9NZ56 1722 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 GNAI2P04899 355 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 CCDC183Q5T5S1 534 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 PPP6R1Q9UPN7 881 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 AGLP35573 1532 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 CHMLP26374 656 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 DCTN1Q14203 1278 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 LRRCC1Q9C099 1032 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 GNAI3P08754 354 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 MX1P20591 662 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP12.75□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 PRDM4Q9UKN5 801 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 OVOS2Q6IE36 1432 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 RAPGEF3O95398 923 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 TPM3P06753 285 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 RNF214Q8ND24 703 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 SPTLC3Q9NUV7 552 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 CCDC61Q9Y6R9 512 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 PEAK1Q9H792 1746 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 APBB1O00213 710 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 SLC4A2P04920 1241 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 KRT24Q2M2I5 525 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 WAPLQ7Z5K2 1190 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 PALD1Q9ULE6 856 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 HSPA4P34932 840 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 ATP8B2P98198 1209 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 SULT6B1Q6IMI4 303 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 USP48Q86UV5 1035 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 ANO2Q9NQ90 1003 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 STAG3Q9UJ98 1225 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 USP31Q70CQ4 1352 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 UBE2HP62256 183 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP12.72□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 ZRANB1Q9UGI0 708 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 TCHHQ07283 1943 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 CHAMP1Q96JM3 812 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-202ENST00000542324 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
CS-202ENST00000542324 AEBP1Q8IUX7 1158 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-202ENST00000542324 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
CS-202ENST00000542324 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
CS-202ENST00000542324 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
CS-202ENST00000542324 MCM10Q7L590 875 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-202ENST00000542324 STK31Q9BXU1 1019 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-202ENST00000542324 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
CS-202ENST00000542324 RAD50Q92878 1312 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-202ENST00000542324 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
CS-202ENST00000542324 RAB11FIP3O75154 756 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-202ENST00000542324 ADCY5O95622 1261 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-202ENST00000542324 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
CS-202ENST00000542324 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-202ENST00000542324 KDRP35968 1356 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-202ENST00000542324 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-202ENST00000542324 KDM4AO75164 1064 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-202ENST00000542324 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
CS-202ENST00000542324 G2E3Q7L622 706 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-202ENST00000542324 TTC14Q96N46 770 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-202ENST00000542324 USP25Q9UHP3 1055 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-202ENST00000542324 TSPYL4Q9UJ04 414 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-202ENST00000542324 SLC4A10Q6U841 1118 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-202ENST00000542324 RILPL2Q969X0 211 aa12.68□□□□□ -0.38
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