RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 KCNQ2O43526 872 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRK-218ENST00000525459 NEUROD2Q15784 382 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRK-218ENST00000525459 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PTPRK-218ENST00000525459 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PTPRK-218ENST00000525459 MCM10Q7L590 875 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRK-218ENST00000525459 RREB1Q92766 1687 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRK-218ENST00000525459 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.52
PTPRK-218ENST00000525459 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PTPRK-218ENST00000525459 BAG6P46379 1132 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRK-218ENST00000525459 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRK-218ENST00000525459 PIGBQ92521 554 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRK-218ENST00000525459 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
PTPRK-218ENST00000525459 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRK-218ENST00000525459 PLSCR1O15162 318 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRK-218ENST00000525459 APBA3O96018 575 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRK-218ENST00000525459 DCTN1Q14203 1278 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRK-218ENST00000525459 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRK-218ENST00000525459 PALLDQ8WX93 1383 aa24.48■■□□□ 1.51
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PTPRK-218ENST00000525459 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRK-218ENST00000525459 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
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PTPRK-218ENST00000525459 C5P01031 1676 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRK-218ENST00000525459 WWC1Q8IX03 1113 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRK-218ENST00000525459 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.45■■□□□ 1.51
PTPRK-218ENST00000525459 BTBD11A6QL63 1104 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRK-218ENST00000525459 TTC5Q8N0Z6 440 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRK-218ENST00000525459 KCPQ6ZWJ8 1503 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRK-218ENST00000525459 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
PTPRK-218ENST00000525459 IL16Q14005 1332 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRK-218ENST00000525459 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
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PTPRK-218ENST00000525459 ATG3Q9NT62 314 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRK-218ENST00000525459 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF790Q6PG37 636 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRK-218ENST00000525459 WDR63Q8IWG1 891 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRK-218ENST00000525459 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRK-218ENST00000525459 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRK-218ENST00000525459 TJP1Q07157 1748 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRK-218ENST00000525459 GNAI1P63096 354 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRK-218ENST00000525459 CFAP44Q96MT7 982 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRK-218ENST00000525459 IFT57Q9NWB7 429 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRK-218ENST00000525459 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRK-218ENST00000525459 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF521Q96K83 1311 aa24.39■■□□□ 1.49
PTPRK-218ENST00000525459 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRK-218ENST00000525459 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRK-218ENST00000525459 CHL1O00533 1208 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRK-218ENST00000525459 SIK1P57059 783 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRK-218ENST00000525459 TXNRD1Q16881 649 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRK-218ENST00000525459 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.38■■□□□ 1.49
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PTPRK-218ENST00000525459 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PTPRK-218ENST00000525459 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.34■■□□□ 1.49
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PTPRK-218ENST00000525459 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
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PTPRK-218ENST00000525459 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
PTPRK-218ENST00000525459 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRK-218ENST00000525459 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRK-218ENST00000525459 GOLGA2Q08379 1002 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRK-218ENST00000525459 PROM2Q8N271 834 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRK-218ENST00000525459 MBIPQ9NS73 344 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRK-218ENST00000525459 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRK-218ENST00000525459 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
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PTPRK-218ENST00000525459 KCNQ3O43525 872 aa24.29■■□□□ 1.48
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PTPRK-218ENST00000525459 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
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PTPRK-218ENST00000525459 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRK-218ENST00000525459 CACNA1FO60840 1977 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRK-218ENST00000525459 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRK-218ENST00000525459 STARD3NLO95772 234 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRK-218ENST00000525459 ITPK1Q13572 414 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRK-218ENST00000525459 NBPF14Q5TI25 921 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRK-218ENST00000525459 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRK-218ENST00000525459 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
PTPRK-218ENST00000525459 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
PTPRK-218ENST00000525459 DNAJC10Q8IXB1 793 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRK-218ENST00000525459 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
PTPRK-218ENST00000525459 SLFN5Q08AF3 891 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRK-218ENST00000525459 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRK-218ENST00000525459 STK32BQ9NY57 414 aa24.21■■□□□ 1.47
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