RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520462.5

TSNARE1-206, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSNARE1, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-206ENST00000520462 NLGN2Q8NFZ4 835 aa20.64■□□□□ 0.89
TSNARE1-206ENST00000520462 CHD4Q14839 1912 aa20.64■□□□□ 0.89
TSNARE1-206ENST00000520462 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
TSNARE1-206ENST00000520462 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
TSNARE1-206ENST00000520462 COL24A1Q17RW2 1714 aa20.63■□□□□ 0.89
TSNARE1-206ENST00000520462 C5P01031 1676 aa20.63■□□□□ 0.89
TSNARE1-206ENST00000520462 DCAF5Q96JK2 942 aa20.62■□□□□ 0.89
TSNARE1-206ENST00000520462 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.62■□□□□ 0.89
TSNARE1-206ENST00000520462 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1-206ENST00000520462 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1-206ENST00000520462 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
TSNARE1-206ENST00000520462 AKAP4Q5JQC9 854 aa20.6■□□□□ 0.89
TSNARE1-206ENST00000520462 AK7Q96M32 723 aa20.6■□□□□ 0.89
TSNARE1-206ENST00000520462 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TSNARE1-206ENST00000520462 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
TSNARE1-206ENST00000520462 FLAD1Q8NFF5 587 aa20.59■□□□□ 0.89
TSNARE1-206ENST00000520462 PIGBQ92521 554 aa20.59■□□□□ 0.89
TSNARE1-206ENST00000520462 ERVV-2B6SEH9 535 aa20.58■□□□□ 0.89
TSNARE1-206ENST00000520462 PRKAR2BP31323 418 aa20.58■□□□□ 0.89
TSNARE1-206ENST00000520462 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.58■□□□□ 0.89
TSNARE1-206ENST00000520462 PHF14O94880 888 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-206ENST00000520462 NEFMP07197 916 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-206ENST00000520462 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-206ENST00000520462 IFFO2Q5TF58 517 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-206ENST00000520462 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1-206ENST00000520462 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1-206ENST00000520462 FCHSD2O94868 740 aa20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1-206ENST00000520462 CABP4P57796 275 aa20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1-206ENST00000520462 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1-206ENST00000520462 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1-206ENST00000520462 C4BP0C0L5 1744 aa20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1-206ENST00000520462 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1-206ENST00000520462 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1-206ENST00000520462 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1-206ENST00000520462 SMIM5Q71RC9 77 aa20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1-206ENST00000520462 GRIN3BO60391 1043 aa20.53■□□□□ 0.88
TSNARE1-206ENST00000520462 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
TSNARE1-206ENST00000520462 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa20.52■□□□□ 0.88
TSNARE1-206ENST00000520462 SIK1P57059 783 aa20.52■□□□□ 0.88
TSNARE1-206ENST00000520462 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.52■□□□□ 0.88
TSNARE1-206ENST00000520462 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
TSNARE1-206ENST00000520462 GNAT3A8MTJ3 354 aa20.51■□□□□ 0.87
TSNARE1-206ENST00000520462 RNMTO43148 476 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
TSNARE1-206ENST00000520462 C1QTNF8P60827 252 aa20.51■□□□□ 0.87
TSNARE1-206ENST00000520462 LINC00116Q8NCU8 138 aa20.51■□□□□ 0.87
TSNARE1-206ENST00000520462 ASAP1Q9ULH1 1129 aa20.51■□□□□ 0.87
TSNARE1-206ENST00000520462 CD2APQ9Y5K6 639 aa20.51■□□□□ 0.87
TSNARE1-206ENST00000520462 ATP6V1AP38606 617 aa20.5■□□□□ 0.87
TSNARE1-206ENST00000520462 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.5■□□□□ 0.87
TSNARE1-206ENST00000520462 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.5■□□□□ 0.87
TSNARE1-206ENST00000520462 LGR6Q9HBX8 967 aa20.49■□□□□ 0.87
TSNARE1-206ENST00000520462 ATG3Q9NT62 314 aa20.49■□□□□ 0.87
TSNARE1-206ENST00000520462 GNPATO15228 680 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-206ENST00000520462 ANP32CO43423 234 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-206ENST00000520462 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-206ENST00000520462 SSFA2P28290 1259 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-206ENST00000520462 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-206ENST00000520462 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1-206ENST00000520462 UBR3Q6ZT12 1888 aa20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1-206ENST00000520462 ITPK1Q13572 414 aa20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1-206ENST00000520462 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.47■□□□□ 0.87
TSNARE1-206ENST00000520462 TEFQ10587 303 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-206ENST00000520462 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-206ENST00000520462 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-206ENST00000520462 WWC3Q9ULE0 1092 aa20.46■□□□□ 0.87
TSNARE1-206ENST00000520462 MRC1P22897 1456 aa20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1-206ENST00000520462 DLG5Q8TDM6 1919 aa20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1-206ENST00000520462 IL17REQ8NFR9 667 aa20.42■□□□□ 0.86
TSNARE1-206ENST00000520462 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-206ENST00000520462 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF831Q5JPB2 1677 aa20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-206ENST00000520462 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1-206ENST00000520462 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1-206ENST00000520462 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1-206ENST00000520462 ATP10DQ9P241 1426 aa20.39■□□□□ 0.85
TSNARE1-206ENST00000520462 NFE2L2Q16236 605 aa20.39■□□□□ 0.85
TSNARE1-206ENST00000520462 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.39■□□□□ 0.85
TSNARE1-206ENST00000520462 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.39■□□□□ 0.85
TSNARE1-206ENST00000520462 MMP10P09238 476 aa20.38■□□□□ 0.85
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC39A6Q13433 755 aa20.38■□□□□ 0.85
TSNARE1-206ENST00000520462 MCM10Q7L590 875 aa20.38■□□□□ 0.85
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC4A9Q96Q91 983 aa20.38■□□□□ 0.85
TSNARE1-206ENST00000520462 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa20.37■□□□□ 0.85
TSNARE1-206ENST00000520462 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
TSNARE1-206ENST00000520462 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.36■□□□□ 0.85
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
TSNARE1-206ENST00000520462 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.36■□□□□ 0.85
TSNARE1-206ENST00000520462 DCTN1Q14203 1278 aa20.35■□□□□ 0.85
TSNARE1-206ENST00000520462 RUNDC1Q96C34 613 aa20.35■□□□□ 0.85
TSNARE1-206ENST00000520462 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TSNARE1-206ENST00000520462 UBR2Q8IWV8 1755 aa20.34■□□□□ 0.85
TSNARE1-206ENST00000520462 BTBD11A6QL63 1104 aa20.34■□□□□ 0.85
TSNARE1-206ENST00000520462 RFC4P35249 363 aa20.34■□□□□ 0.85
TSNARE1-206ENST00000520462 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.34■□□□□ 0.85
TSNARE1-206ENST00000520462 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TSNARE1-206ENST00000520462 TJP1Q07157 1748 aa20.33■□□□□ 0.85
TSNARE1-206ENST00000520462 RIPK4P57078 832 aa20.33■□□□□ 0.85
TSNARE1-206ENST00000520462 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF790Q6PG37 636 aa20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms