RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	GLI2	P10070	1586 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	NUCB1	Q02818	461 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	EVC2	Q86UK5	1308 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	TRAK2	O60296	914 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	CLCN1	P35523	988 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	ASXL2	Q76L83	1435 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A1W2PP64	1363 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	MRE11	P49959	708 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	AMHR2	Q16671	573 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	TATDN2	Q93075	761 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	PHOX2B	Q99453	314 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	KIF2C	Q99661	725 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	PANK2	Q9BZ23	570 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	PNMA3	Q9UL41	463 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	PTPRM	P28827	1452 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	NBPF26	B4DH59	902 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	C3orf80	F5H4A9	247 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	HSCB	Q8IWL3	235 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	EYA1	Q99502	592 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	PTCH1	Q13635	1447 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	KIF16B	Q96L93	1317 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	RERE	Q9P2R6	1566 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	FYB1	O15117	783 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF428	Q96B54	188 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		6.21	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ATXN3-212	ENST00000515746	TK2	O00142	265 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ATXN3-212	ENST00000515746	SMAP	O00193	183 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ATXN3-212	ENST00000515746	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	6.21	□□□□□ -1.42
ATXN3-212	ENST00000515746	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
ATXN3-212	ENST00000515746	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ATXN3-212	ENST00000515746	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
ATXN3-212	ENST00000515746	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ATXN3-212	ENST00000515746	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
ATXN3-212	ENST00000515746	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ATXN3-212	ENST00000515746	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ATXN3-212	ENST00000515746	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ATXN3-212	ENST00000515746	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ATXN3-212	ENST00000515746	ERBB4	Q15303	1308 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ATXN3-212	ENST00000515746	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ATXN3-212	ENST00000515746	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ATXN3-212	ENST00000515746	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
ATXN3-212	ENST00000515746	RCCD1	A6NED2	376 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ATXN3-212	ENST00000515746	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF853	P0CG23	659 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ATXN3-212	ENST00000515746	PTMS	P20962	102 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ATXN3-212	ENST00000515746	RIPK4	P57078	832 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ATXN3-212	ENST00000515746	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
ATXN3-212	ENST00000515746	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ATXN3-212	ENST00000515746	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		6.2	□□□□□ -1.42

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