RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465282.5

USP39-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 4

Gene USP39, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-211ENST00000465282 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
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USP39-211ENST00000465282 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
USP39-211ENST00000465282 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.35■■□□□ 1.17
USP39-211ENST00000465282 TEFQ10587 303 aa22.34■■□□□ 1.17
USP39-211ENST00000465282 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.34■■□□□ 1.17
USP39-211ENST00000465282 RIPK4P57078 832 aa22.33■■□□□ 1.17
USP39-211ENST00000465282 TXNRD1Q16881 649 aa22.33■■□□□ 1.17
USP39-211ENST00000465282 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.32■■□□□ 1.16
USP39-211ENST00000465282 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.31■■□□□ 1.16
USP39-211ENST00000465282 PALLDQ8WX93 1383 aa22.31■■□□□ 1.16
USP39-211ENST00000465282 PROM2Q8N271 834 aa22.31■■□□□ 1.16
USP39-211ENST00000465282 ATG3Q9NT62 314 aa22.31■■□□□ 1.16
USP39-211ENST00000465282 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.3■■□□□ 1.16
USP39-211ENST00000465282 PAPPAQ13219 1627 aa22.29■■□□□ 1.16
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USP39-211ENST00000465282 MCM10Q7L590 875 aa22.29■■□□□ 1.16
USP39-211ENST00000465282 MIER1Q8N108 512 aa22.29■■□□□ 1.16
USP39-211ENST00000465282 APAF1O14727 1248 aa22.27■■□□□ 1.16
USP39-211ENST00000465282 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.27■■□□□ 1.16
USP39-211ENST00000465282 DCTN1Q14203 1278 aa22.26■■□□□ 1.15
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USP39-211ENST00000465282 NBPF14Q5TI25 921 aa22.26■■□□□ 1.15
USP39-211ENST00000465282 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
USP39-211ENST00000465282 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.26■■□□□ 1.15
USP39-211ENST00000465282 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.25■■□□□ 1.15
USP39-211ENST00000465282 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.25■■□□□ 1.15
USP39-211ENST00000465282 SIK1P57059 783 aa22.25■■□□□ 1.15
USP39-211ENST00000465282 NEUROD2Q15784 382 aa22.25■■□□□ 1.15
USP39-211ENST00000465282 NGEFQ8N5V2 710 aa22.25■■□□□ 1.15
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USP39-211ENST00000465282 BTBD11A6QL63 1104 aa22.23■■□□□ 1.15
USP39-211ENST00000465282 ZNF790Q6PG37 636 aa22.23■■□□□ 1.15
USP39-211ENST00000465282 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.23■■□□□ 1.15
USP39-211ENST00000465282 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.23■■□□□ 1.15
USP39-211ENST00000465282 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.23■■□□□ 1.15
USP39-211ENST00000465282 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.23■■□□□ 1.15
USP39-211ENST00000465282 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
USP39-211ENST00000465282 CCDC27Q2M243 656 aa22.22■■□□□ 1.15
USP39-211ENST00000465282 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
USP39-211ENST00000465282 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
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USP39-211ENST00000465282 SLC39A6Q13433 755 aa22.2■■□□□ 1.14
USP39-211ENST00000465282 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.2■■□□□ 1.14
USP39-211ENST00000465282 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.2■■□□□ 1.14
USP39-211ENST00000465282 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
USP39-211ENST00000465282 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.19■■□□□ 1.14
USP39-211ENST00000465282 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
USP39-211ENST00000465282 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
USP39-211ENST00000465282 STK32BQ9NY57 414 aa22.18■■□□□ 1.14
USP39-211ENST00000465282 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.17■■□□□ 1.14
USP39-211ENST00000465282 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.17■■□□□ 1.14
USP39-211ENST00000465282 C4BP0C0L5 1744 aa22.17■■□□□ 1.14
USP39-211ENST00000465282 SLC15A2Q16348 729 aa22.16■■□□□ 1.14
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USP39-211ENST00000465282 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.13■■□□□ 1.13
USP39-211ENST00000465282 CHL1O00533 1208 aa22.12■■□□□ 1.13
USP39-211ENST00000465282 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.12■■□□□ 1.13
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USP39-211ENST00000465282 STARD3NLO95772 234 aa22.11■■□□□ 1.13
USP39-211ENST00000465282 GNAI1P63096 354 aa22.11■■□□□ 1.13
USP39-211ENST00000465282 IFT57Q9NWB7 429 aa22.11■■□□□ 1.13
USP39-211ENST00000465282 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.11■■□□□ 1.13
USP39-211ENST00000465282 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.11■■□□□ 1.13
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USP39-211ENST00000465282 AK7Q96M32 723 aa22.1■■□□□ 1.13
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USP39-211ENST00000465282 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
USP39-211ENST00000465282 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.1■■□□□ 1.13
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USP39-211ENST00000465282 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
USP39-211ENST00000465282 SSFA2P28290 1259 aa22.06■■□□□ 1.12
USP39-211ENST00000465282 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
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USP39-211ENST00000465282 CASZ1Q86V15 1759 aa22.05■■□□□ 1.12
USP39-211ENST00000465282 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
USP39-211ENST00000465282 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
USP39-211ENST00000465282 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.05■■□□□ 1.12
USP39-211ENST00000465282 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
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