RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
ECHDC1-211ENST00000460558 DAPK1P53355 1430 aa6.28□□□□□ -1.4
ECHDC1-211ENST00000460558 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
ECHDC1-211ENST00000460558 PLSCR1O15162 318 aa6.28□□□□□ -1.4
ECHDC1-211ENST00000460558 GRIN3BO60391 1043 aa6.28□□□□□ -1.4
ECHDC1-211ENST00000460558 DOK7Q18PE1 504 aa6.28□□□□□ -1.4
ECHDC1-211ENST00000460558 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa6.28□□□□□ -1.4
ECHDC1-211ENST00000460558 ADAM33Q9BZ11 813 aa6.28□□□□□ -1.4
ECHDC1-211ENST00000460558 WWC3Q9ULE0 1092 aa6.28□□□□□ -1.4
ECHDC1-211ENST00000460558 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa6.28□□□□□ -1.4
ECHDC1-211ENST00000460558 SBNO1A3KN83 1393 aa6.28□□□□□ -1.4
ECHDC1-211ENST00000460558 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa6.28□□□□□ -1.4
ECHDC1-211ENST00000460558 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa6.27□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 NAIPQ13075 1403 aa6.27□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 AKAP12Q02952 1782 aa6.27□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 A6NJR5 290 aa6.27□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 PRSS12P56730 875 aa6.27□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.27□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 STK32BQ9NY57 414 aa6.27□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 ALS2Q96Q42 1657 aa6.26□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 COL24A1Q17RW2 1714 aa6.26□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 PEAK1Q9H792 1746 aa6.26□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 NUDT7P0C024 238 aa6.26□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 MCM6Q14566 821 aa6.26□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM161AQ3B820 660 aa6.26□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 BEGAINQ9BUH8 593 aa6.26□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 C1orf115Q9H7X2 142 aa6.26□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 TECPR2O15040 1411 aa6.25□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 ARSIQ5FYB1 569 aa6.25□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 JMYQ8N9B5 988 aa6.25□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 CDCA7LQ96GN5 454 aa6.25□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 QSER1Q2KHR3 1735 aa6.25□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa6.25□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa6.25□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 OVOS2Q6IE36 1432 aa6.25□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa6.25□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 NRXN1Q9ULB1 1477 aa6.24□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 ADCY9O60503 1353 aa6.24□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 POTEB2H3BUK9 544 aa6.24□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC15A2Q16348 729 aa6.24□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 MYSM1Q5VVJ2 828 aa6.24□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.412e-12■■■□□ 17
ECHDC1-211ENST00000460558 KLRG1Q96E93 195 aa6.24□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 EYA1Q99502 592 aa6.24□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 BCL2L12Q9HB09 334 aa6.24□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 PRDM11Q9NQV5 511 aa6.24□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 USP35Q9P2H5 1018 aa6.24□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM198AQ9UFP1 575 aa6.24□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.24□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 KNDC1Q76NI1 1749 aa6.24□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 CLTCL1P53675 1640 aa6.24□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 PCNTO95613 3336 aa6.24□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 RIMBP2O15034 1052 aa6.23□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 NLRP7Q8WX94 980 aa6.23□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 STRN4Q9NRL3 753 aa6.23□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 PPLO60437 1756 aa6.23□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.22□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 COL9A1P20849 921 aa6.22□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 POLD1P28340 1107 aa6.22□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 DIXDC1Q155Q3 683 aa6.22□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 LRRC37A3O60309 1634 aa6.21□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
ECHDC1-211ENST00000460558 WNK3Q9BYP7 1800 aa6.21□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.21□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 TOMM70O94826 608 aa6.21□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 TXNRD1Q16881 649 aa6.21□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.21□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 TCP11L2Q8N4U5 519 aa6.21□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 LHX6Q9UPM6 363 aa6.21□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 TNS2Q63HR2 1409 aa6.21□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 SSH2Q76I76 1423 aa6.21□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa6.21□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 ATP7BP35670 1465 aa6.21□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa6.2□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 TULP4Q9NRJ4 1543 aa6.2□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 RCCD1A6NED2 376 aa6.2□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 TRAK2O60296 914 aa6.2□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 CD46P15529 392 aa6.2□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 EVA1CP58658 441 aa6.2□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa6.2□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.2□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 NLGN2Q8NFZ4 835 aa6.2□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 TBC1D2Q9BYX2 928 aa6.2□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 TSKSQ9UJT2 592 aa6.2□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 PAPPAQ13219 1627 aa6.2□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 KIAA0232Q92628 1395 aa6.19□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 GJA5P36382 358 aa6.19□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 BANK1Q8NDB2 785 aa6.19□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC16A10Q8TF71 515 aa6.19□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 CLUAP1Q96AJ1 413 aa6.19□□□□□ -1.42
ECHDC1-211ENST00000460558 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
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