RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	GC	P02774	474 aa		14.25	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		14.25	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	FOXO3	O43524	673 aa		14.24	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	TTC22	Q5TAA0	569 aa		14.24	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		14.24	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		14.24	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	14.24	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		14.24	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	14.24	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	14.23	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	AOX1	Q06278	1338 aa		14.23	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	REC8	O95072	547 aa		14.23	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		14.23	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		14.23	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		14.23	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		14.23	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		14.23	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		14.23	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	14.23	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		14.23	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		14.22	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	14.22	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		14.22	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	14.22	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		14.22	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	COL18A1	P39060	1754 aa		14.22	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	14.21	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	RAB11FIP3	O75154	756 aa		14.21	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		14.21	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		14.21	□□□□□ -0.13
TTLL3-222	ENST00000459758	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		14.2	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		14.2	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	14.2	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	KRT24	Q2M2I5	525 aa		14.2	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		14.2	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		14.2	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	NBPF4	Q96M43	638 aa		14.2	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	MEIS3	Q99687	375 aa		14.2	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	14.2	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	BTBD11	A6QL63	1104 aa		14.19	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	14.19	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	14.19	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	ATP8B2	P98198	1209 aa		14.19	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	RABEP1	Q15276	862 aa		14.19	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		14.19	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		14.19	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		14.19	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	SPG7	Q9UQ90	795 aa		14.19	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC4A3	P48751	1232 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	GSE1	Q14687	1217 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	ALDH1L1	O75891	902 aa		14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	MCC	P23508	829 aa		14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	HYPK	Q9NX55	129 aa		14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	ERBB3	P21860	1342 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	14.16	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	ORAI2	Q96SN7	254 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	CPD	O75976	1380 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	14.15	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	G2E3	Q7L622	706 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	14.15	□□□□□ -0.14
TTLL3-222	ENST00000459758	MRC1	P22897	1456 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM94	Q12767	1356 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758	ERC2	O15083	957 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758	ST18	O60284	1047 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758	MCM2	P49736	904 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758	GBP4	Q96PP9	640 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758		F6X3S4	739 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	14.13	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758	SSH3	Q8TE77	659 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	14.13	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758	STAP2	Q9UGK3	403 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	14.12	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758	MX1	P20591	662 aa		14.12	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758	PDE1A	P54750	535 aa		14.12	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		14.12	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758	GPATCH3	Q96I76	525 aa		14.12	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758	PXDN	Q92626	1479 aa		14.12	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758	C5	P01031	1676 aa		14.11	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		14.11	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		14.11	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	14.11	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	14.1	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	14.1	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758	SDS	P20132	328 aa		14.1	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758	ANAPC15	P60006	121 aa		14.1	□□□□□ -0.15
TTLL3-222	ENST00000459758	MTX1	Q13505	466 aa		14.1	□□□□□ -0.15

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