RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446477.6

PRRT4-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PRRT4, Length 3,544 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-201ENST00000446477 KIF16BQ96L93 1317 aa20.34■□□□□ 0.85
PRRT4-201ENST00000446477 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PRRT4-201ENST00000446477 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.34■□□□□ 0.85
PRRT4-201ENST00000446477 RILPL2Q969X0 211 aa20.34■□□□□ 0.85
PRRT4-201ENST00000446477 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.34■□□□□ 0.85
PRRT4-201ENST00000446477 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PRRT4-201ENST00000446477 USP6P35125 1406 aa20.34■□□□□ 0.85
PRRT4-201ENST00000446477 NINLQ9Y2I6 1382 aa20.34■□□□□ 0.85
PRRT4-201ENST00000446477 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.33■□□□□ 0.85
PRRT4-201ENST00000446477 DYNC1I1O14576 645 aa20.33■□□□□ 0.85
PRRT4-201ENST00000446477 FLT4P35916 1363 aa20.33■□□□□ 0.84
PRRT4-201ENST00000446477 MSH6P52701 1360 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT4-201ENST00000446477 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT4-201ENST00000446477 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PRRT4-201ENST00000446477 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PRRT4-201ENST00000446477 IFT57Q9NWB7 429 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT4-201ENST00000446477 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT4-201ENST00000446477 SEC24BO95487 1268 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT4-201ENST00000446477 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PRRT4-201ENST00000446477 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PRRT4-201ENST00000446477 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT4-201ENST00000446477 NRXN1Q9ULB1 1477 aa20.31■□□□□ 0.84
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PRRT4-201ENST00000446477 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PRRT4-201ENST00000446477 IQGAP1P46940 1657 aa20.31■□□□□ 0.84
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PRRT4-201ENST00000446477 TERF1P54274 439 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT4-201ENST00000446477 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT4-201ENST00000446477 TTC21AQ8NDW8 1320 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT4-201ENST00000446477 IP6K1Q92551 441 aa20.3■□□□□ 0.84
PRRT4-201ENST00000446477 GAS2L3Q86XJ1 694 aa20.3■□□□□ 0.84
PRRT4-201ENST00000446477 PI4KAP2A4QPH2 592 aa20.3■□□□□ 0.84
PRRT4-201ENST00000446477 KCNQ4P56696 695 aa20.3■□□□□ 0.84
PRRT4-201ENST00000446477 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa20.3■□□□□ 0.84
PRRT4-201ENST00000446477 ANTXR1Q9H6X2 564 aa20.3■□□□□ 0.84
PRRT4-201ENST00000446477 BTG4Q9NY30 223 aa20.3■□□□□ 0.84
PRRT4-201ENST00000446477 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PRRT4-201ENST00000446477 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.28■□□□□ 0.84
PRRT4-201ENST00000446477 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.28■□□□□ 0.84
PRRT4-201ENST00000446477 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PRRT4-201ENST00000446477 CERS3Q8IU89 383 aa20.27■□□□□ 0.84
PRRT4-201ENST00000446477 NPHP1O15259 732 aa20.27■□□□□ 0.84
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PRRT4-201ENST00000446477 AGLP35573 1532 aa20.27■□□□□ 0.84
PRRT4-201ENST00000446477 FLIIQ13045 1269 aa20.27■□□□□ 0.83
PRRT4-201ENST00000446477 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.27■□□□□ 0.83
PRRT4-201ENST00000446477 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.26■□□□□ 0.83
PRRT4-201ENST00000446477 CD163L1Q9NR16 1453 aa20.26■□□□□ 0.83
PRRT4-201ENST00000446477 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PRRT4-201ENST00000446477 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PRRT4-201ENST00000446477 DTNBO60941 627 aa20.25■□□□□ 0.83
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PRRT4-201ENST00000446477 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
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PRRT4-201ENST00000446477 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PRRT4-201ENST00000446477 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT4-201ENST00000446477 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.24■□□□□ 0.83
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PRRT4-201ENST00000446477 C8orf37Q96NL8 207 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT4-201ENST00000446477 BRINP3Q76B58 766 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT4-201ENST00000446477 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PRRT4-201ENST00000446477 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT4-201ENST00000446477 KIAA0232Q92628 1395 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT4-201ENST00000446477 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PRRT4-201ENST00000446477 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PRRT4-201ENST00000446477 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PRRT4-201ENST00000446477 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PRRT4-201ENST00000446477 ATP7BP35670 1465 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT4-201ENST00000446477 TAF3Q5VWG9 929 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT4-201ENST00000446477 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT4-201ENST00000446477 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT4-201ENST00000446477 CCDC27Q2M243 656 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT4-201ENST00000446477 PROSER3Q2NL68 480 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT4-201ENST00000446477 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT4-201ENST00000446477 BRD2P25440 801 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PRRT4-201ENST00000446477 KCNJ4P48050 445 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRT4-201ENST00000446477 TSC1Q92574 1164 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRT4-201ENST00000446477 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRT4-201ENST00000446477 ARHGEF25Q86VW2 580 aa20.2■□□□□ 0.82
PRRT4-201ENST00000446477 SIRT1Q96EB6 747 aa20.2■□□□□ 0.82
PRRT4-201ENST00000446477 NGLY1Q96IV0 654 aa20.2■□□□□ 0.82
PRRT4-201ENST00000446477 INSRP06213 1382 aa20.2■□□□□ 0.82
PRRT4-201ENST00000446477 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PRRT4-201ENST00000446477 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.2■□□□□ 0.82
PRRT4-201ENST00000446477 SBNO1A3KN83 1393 aa20.2■□□□□ 0.82
PRRT4-201ENST00000446477 USP19O94966 1318 aa20.19■□□□□ 0.82
PRRT4-201ENST00000446477 SRGAP3O43295 1099 aa20.19■□□□□ 0.82
PRRT4-201ENST00000446477 GPTP24298 496 aa20.19■□□□□ 0.82
PRRT4-201ENST00000446477 FAM135BQ49AJ0 1406 aa20.19■□□□□ 0.82
PRRT4-201ENST00000446477 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PRRT4-201ENST00000446477 CHL1O00533 1208 aa20.18■□□□□ 0.82
PRRT4-201ENST00000446477 GBP4Q96PP9 640 aa20.18■□□□□ 0.82
PRRT4-201ENST00000446477 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PRRT4-201ENST00000446477 MYO3AQ8NEV4 1616 aa20.18■□□□□ 0.82
PRRT4-201ENST00000446477 LMTK3Q96Q04 1460 aa20.18■□□□□ 0.82
PRRT4-201ENST00000446477 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa20.18■□□□□ 0.82
PRRT4-201ENST00000446477 SMIM5Q71RC9 77 aa20.18■□□□□ 0.82
PRRT4-201ENST00000446477 SPG7Q9UQ90 795 aa20.18■□□□□ 0.82
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