RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432886.6

SRPX-202, Transcript of sushi repeat containing protein X-linked, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRPX, Length 1,725 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPX-202ENST00000432886 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SRPX-202ENST00000432886 SEPT12Q8IYM1 358 aa23.06■■□□□ 1.28
SRPX-202ENST00000432886 MBIPQ9NS73 344 aa23.05■■□□□ 1.28
SRPX-202ENST00000432886 ITGB4P16144 1822 aa23.05■■□□□ 1.28
SRPX-202ENST00000432886 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.05■■□□□ 1.28
SRPX-202ENST00000432886 EP400Q96L91 3159 aa23.04■■□□□ 1.28
SRPX-202ENST00000432886 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SRPX-202ENST00000432886 CHL1O00533 1208 aa23.03■■□□□ 1.28
SRPX-202ENST00000432886 POTEAQ6S8J7 498 aa23.03■■□□□ 1.28
SRPX-202ENST00000432886 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.03■■□□□ 1.28
SRPX-202ENST00000432886 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.03■■□□□ 1.28
SRPX-202ENST00000432886 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.02■■□□□ 1.28
SRPX-202ENST00000432886 CABP4P57796 275 aa23.02■■□□□ 1.28
SRPX-202ENST00000432886 RXRBP28702 533 aa23.01■■□□□ 1.27
SRPX-202ENST00000432886 ERVV-2B6SEH9 535 aa23■■□□□ 1.27
SRPX-202ENST00000432886 FAM182BQ5T319 152 aa23■■□□□ 1.27
SRPX-202ENST00000432886 BTBD11A6QL63 1104 aa22.99■■□□□ 1.27
SRPX-202ENST00000432886 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SRPX-202ENST00000432886 RGS12O14924 1447 aa22.97■■□□□ 1.27
SRPX-202ENST00000432886 PAPPAQ13219 1627 aa22.97■■□□□ 1.27
SRPX-202ENST00000432886 KCNQ3O43525 872 aa22.96■■□□□ 1.27
SRPX-202ENST00000432886 KRT24Q2M2I5 525 aa22.96■■□□□ 1.27
SRPX-202ENST00000432886 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SRPX-202ENST00000432886 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.96■■□□□ 1.27
SRPX-202ENST00000432886 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.96■■□□□ 1.27
SRPX-202ENST00000432886 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.96■■□□□ 1.27
SRPX-202ENST00000432886 SLC39A6Q13433 755 aa22.95■■□□□ 1.26
SRPX-202ENST00000432886 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SRPX-202ENST00000432886 SBF2Q86WG5 1849 aa22.94■■□□□ 1.26
SRPX-202ENST00000432886 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SRPX-202ENST00000432886 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.94■■□□□ 1.26
SRPX-202ENST00000432886 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.94■■□□□ 1.26
SRPX-202ENST00000432886 PIGBQ92521 554 aa22.94■■□□□ 1.26
SRPX-202ENST00000432886 BCL9O00512 1426 aa22.93■■□□□ 1.26
SRPX-202ENST00000432886 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.93■■□□□ 1.26
SRPX-202ENST00000432886 TSPYL6Q8N831 410 aa22.93■■□□□ 1.26
SRPX-202ENST00000432886 NHSQ6T4R5 1651 aa22.92■■□□□ 1.26
SRPX-202ENST00000432886 ZNF790Q6PG37 636 aa22.92■■□□□ 1.26
SRPX-202ENST00000432886 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SRPX-202ENST00000432886 KCNQ2O43526 872 aa22.91■■□□□ 1.26
SRPX-202ENST00000432886 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SRPX-202ENST00000432886 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.9■■□□□ 1.26
SRPX-202ENST00000432886 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
SRPX-202ENST00000432886 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.89■■□□□ 1.26
SRPX-202ENST00000432886 C5P01031 1676 aa22.89■■□□□ 1.25
SRPX-202ENST00000432886 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.88■■□□□ 1.25
SRPX-202ENST00000432886 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.88■■□□□ 1.25
SRPX-202ENST00000432886 BTAF1O14981 1849 aa22.88■■□□□ 1.25
SRPX-202ENST00000432886 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.87■■□□□ 1.25
SRPX-202ENST00000432886 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SRPX-202ENST00000432886 VAMP4O75379 141 aa22.85■■□□□ 1.25
SRPX-202ENST00000432886 ATG3Q9NT62 314 aa22.85■■□□□ 1.25
SRPX-202ENST00000432886 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SRPX-202ENST00000432886 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SRPX-202ENST00000432886 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.84■■□□□ 1.25
SRPX-202ENST00000432886 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.84■■□□□ 1.25
SRPX-202ENST00000432886 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.83■■□□□ 1.25
SRPX-202ENST00000432886 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.83■■□□□ 1.25
SRPX-202ENST00000432886 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.83■■□□□ 1.25
SRPX-202ENST00000432886 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SRPX-202ENST00000432886 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.82■■□□□ 1.24
SRPX-202ENST00000432886 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SRPX-202ENST00000432886 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SRPX-202ENST00000432886 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SRPX-202ENST00000432886 BCAR3O75815 825 aa22.81■■□□□ 1.24
SRPX-202ENST00000432886 NECTIN2Q92692 538 aa22.81■■□□□ 1.24
SRPX-202ENST00000432886 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.8■■□□□ 1.24
SRPX-202ENST00000432886 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SRPX-202ENST00000432886 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.79■■□□□ 1.24
SRPX-202ENST00000432886 PALLDQ8WX93 1383 aa22.78■■□□□ 1.24
SRPX-202ENST00000432886 TRIM37O94972 964 aa22.78■■□□□ 1.24
SRPX-202ENST00000432886 HOXB7P09629 217 aa22.78■■□□□ 1.24
SRPX-202ENST00000432886 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SRPX-202ENST00000432886 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SRPX-202ENST00000432886 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SRPX-202ENST00000432886 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.77■■□□□ 1.24
SRPX-202ENST00000432886 ZNF428Q96B54 188 aa22.77■■□□□ 1.24
SRPX-202ENST00000432886 TJP1Q07157 1748 aa22.77■■□□□ 1.24
SRPX-202ENST00000432886 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.23
SRPX-202ENST00000432886 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.76■■□□□ 1.23
SRPX-202ENST00000432886 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.75■■□□□ 1.23
SRPX-202ENST00000432886 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SRPX-202ENST00000432886 USP16Q9Y5T5 823 aa22.74■■□□□ 1.23
SRPX-202ENST00000432886 LY75O60449 1722 aa22.74■■□□□ 1.23
SRPX-202ENST00000432886 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.74■■□□□ 1.23
SRPX-202ENST00000432886 PLIN1O60240 522 aa22.73■■□□□ 1.23
SRPX-202ENST00000432886 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SRPX-202ENST00000432886 CACNA1FO60840 1977 aa22.72■■□□□ 1.23
SRPX-202ENST00000432886 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.72■■□□□ 1.23
SRPX-202ENST00000432886 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SRPX-202ENST00000432886 SIK1P57059 783 aa22.72■■□□□ 1.23
SRPX-202ENST00000432886 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.72■■□□□ 1.23
SRPX-202ENST00000432886 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SRPX-202ENST00000432886 STK31Q9BXU1 1019 aa22.72■■□□□ 1.23
SRPX-202ENST00000432886 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.71■■□□□ 1.23
SRPX-202ENST00000432886 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SRPX-202ENST00000432886 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.71■■□□□ 1.23
SRPX-202ENST00000432886 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SRPX-202ENST00000432886 SLC4A2P04920 1241 aa22.71■■□□□ 1.23
SRPX-202ENST00000432886 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms