RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 PTPRTO14522 1441 aa12.99□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 CCT4P50991 539 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 STK3Q13188 491 aa12.98□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 ATF3P18847 181 aa12.98□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 TXLNBQ8N3L3 684 aa12.98□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 TRPM2O94759 1503 aa12.98□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM177BA6PVY3 158 aa12.98□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 PLCD4Q9BRC7 762 aa12.98□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 NACAP1Q9BZK3 213 aa12.98□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 MROH2AA6NES4 1674 aa12.98□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa12.98□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP12.98□□□□□ -0.338e-7■■■□□ 15.8
EFTUD2-202ENST00000426333 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 EFCAB6Q5THR3 1501 aa12.97□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 CBFA2T2O43439 604 aa12.97□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 CFAP45Q9UL16 551 aa12.97□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 PKNOX2Q96KN3 472 aa12.96□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 CNNM1Q9NRU3 951 aa12.96□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 UQCRHLA0A096LP55 91 aa12.96□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 UQCRHP07919 91 aa12.96□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 SPATA32Q96LK8 384 aa12.96□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 NUP62CLQ9H1M0 184 aa12.96□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM132AQ24JP5 1023 aa12.96□□□□□ -0.33
EFTUD2-202ENST00000426333 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 ABTB2Q8N961 1025 aa12.96□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 A2MP01023 1474 aa12.96□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 MVPQ14764 893 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 UBXN4Q92575 508 aa12.95□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 ZHX3Q9H4I2 956 aa12.95□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP6R1Q9UPN7 881 aa12.95□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 USP8P40818 1118 aa12.95□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 CHD1LQ86WJ1 897 aa12.95□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 SULT6B1Q6IMI4 303 aa12.95□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR63Q8IWG1 891 aa12.95□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 TANGO6Q9C0B7 1094 aa12.95□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 CENPHQ9H3R5 247 aa12.95□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 NEURL4Q96JN8 1562 aa12.95□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC39AQ5SRH9 613 aa12.94□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 RRP9O43818 475 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 ZSCAN30Q86W11 494 aa12.94□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 UGGT1Q9NYU2 1555 aa12.94□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF6Q6ZMV9 814 aa12.94□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 TAX1BP1Q86VP1 789 aa12.94□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 STK11IPQ8N1F8 1099 aa12.94□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa12.94□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD62A6NC57 917 aa12.94□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 SIL1Q9H173 461 aa12.94□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 YEATS2Q9ULM3 1422 aa12.94□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa12.93□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 PDCL2Q8N4E4 241 aa12.93□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 CDKL5O76039 1030 aa12.93□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 PIK3C2BO00750 1634 aa12.93□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 GPRASP1Q5JY77 1395 aa12.93□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT32Q14532 448 aa12.93□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa12.93□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 SOGA3Q5TF21 947 aa12.92□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 IQCEQ6IPM2 695 aa12.92□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC69A6NI79 296 aa12.92□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 SRGAP3O43295 1099 aa12.92□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 EZRP15311 586 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP2B2Q01814 1243 aa12.92□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 WWC2Q6AWC2 1192 aa12.92□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 CTNNA3Q9UI47 895 aa12.92□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa12.92□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 MADDQ8WXG6 1647 aa12.92□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 NUP133Q8WUM0 1156 aa12.92□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF428Q96B54 188 aa12.92□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 PDRG1Q9NUG6 133 aa12.92□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 REREQ9P2R6 1566 aa12.91□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 NBPF1Q3BBV0 1214 aa12.91□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC102AQ96A19 550 aa12.91□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP3K11Q16584 847 aa12.91□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP126Q9P2H0 1117 aa12.91□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 LAMC1P11047 1609 aa12.91□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 RALGAPBQ86X10 1494 aa12.91□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa12.91□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 SMTNL1A8MU46 457 aa12.91□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP12.91□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 CFAP100Q494V2 611 aa12.91□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCC3O15438 1527 aa12.9□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 RAPGEF3O95398 923 aa12.9□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 TATP17735 454 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67 ms