RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa36.01■■■■□ 3.36
TPGS1-201ENST00000359315 SLC4A9Q96Q91 983 aa36.01■■■■□ 3.36
TPGS1-201ENST00000359315 SLC52A2Q9HAB3 445 aa36.01■■■■□ 3.36
TPGS1-201ENST00000359315 SCN11AQ9UI33 1791 aa36.01■■■■□ 3.35
TPGS1-201ENST00000359315 ITPK1Q13572 414 aa36■■■■□ 3.35
TPGS1-201ENST00000359315 ZBTB7AO95365 584 aa35.98■■■■□ 3.35
TPGS1-201ENST00000359315 IL17REQ8NFR9 667 aa35.98■■■■□ 3.35
TPGS1-201ENST00000359315 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa35.98■■■■□ 3.35
TPGS1-201ENST00000359315 C5P01031 1676 aa35.97■■■■□ 3.35
TPGS1-201ENST00000359315 GNAT3A8MTJ3 354 aa35.97■■■■□ 3.35
TPGS1-201ENST00000359315 LINC00116Q8NCU8 138 aa35.97■■■■□ 3.35
TPGS1-201ENST00000359315 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa35.96■■■■□ 3.35
TPGS1-201ENST00000359315 PLEKHF1Q96S99 279 aa35.95■■■■□ 3.35
TPGS1-201ENST00000359315 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
TPGS1-201ENST00000359315 ATP6V1AP38606 617 aa35.94■■■■□ 3.34
TPGS1-201ENST00000359315 AMIGO3Q86WK7 504 aa35.94■■■■□ 3.34
TPGS1-201ENST00000359315 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
TPGS1-201ENST00000359315 SLC39A6Q13433 755 aa35.92■■■■□ 3.34
TPGS1-201ENST00000359315 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa35.92■■■■□ 3.34
TPGS1-201ENST00000359315 C4BP0C0L5 1744 aa35.91■■■■□ 3.34
TPGS1-201ENST00000359315 SMIM5Q71RC9 77 aa35.91■■■■□ 3.34
TPGS1-201ENST00000359315 TAF1LQ8IZX4 1826 aa35.9■■■■□ 3.34
TPGS1-201ENST00000359315 SPON1Q9HCB6 807 aa35.9■■■■□ 3.34
TPGS1-201ENST00000359315 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
TPGS1-201ENST00000359315 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa35.89■■■■□ 3.34
TPGS1-201ENST00000359315 DCTN1Q14203 1278 aa35.86■■■■□ 3.33
TPGS1-201ENST00000359315 MCM10Q7L590 875 aa35.86■■■■□ 3.33
TPGS1-201ENST00000359315 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
TPGS1-201ENST00000359315 AK7Q96M32 723 aa35.86■■■■□ 3.33
TPGS1-201ENST00000359315 KCPQ6ZWJ8 1503 aa35.84■■■■□ 3.33
TPGS1-201ENST00000359315 QSER1Q2KHR3 1735 aa35.84■■■■□ 3.33
TPGS1-201ENST00000359315 PTGER2P43116 358 aa35.84■■■■□ 3.33
TPGS1-201ENST00000359315 MTFR1LQ9H019 292 aa35.84■■■■□ 3.33
TPGS1-201ENST00000359315 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
TPGS1-201ENST00000359315 TEFQ10587 303 aa35.83■■■■□ 3.33
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC184Q52MB2 194 aa35.82■■■■□ 3.32
TPGS1-201ENST00000359315 PHF14O94880 888 aa35.81■■■■□ 3.32
TPGS1-201ENST00000359315 SGIP1Q9BQI5 828 aa35.8■■■■□ 3.32
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF831Q5JPB2 1677 aa35.8■■■■□ 3.32
TPGS1-201ENST00000359315 GNPATO15228 680 aa35.79■■■■□ 3.32
TPGS1-201ENST00000359315 NEFMP07197 916 aa35.79■■■■□ 3.32
TPGS1-201ENST00000359315 NFE2L2Q16236 605 aa35.79■■■■□ 3.32
TPGS1-201ENST00000359315 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
TPGS1-201ENST00000359315 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa35.79■■■■□ 3.32
TPGS1-201ENST00000359315 MSH5O43196 834 aa35.78■■■■□ 3.32
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC146Q8IYE0 955 aa35.78■■■■□ 3.32
TPGS1-201ENST00000359315 TJP1Q07157 1748 aa35.77■■■■□ 3.32
TPGS1-201ENST00000359315 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP35.77■■■■□ 3.32
TPGS1-201ENST00000359315 ADAMTS8Q9UP79 889 aa35.77■■■■□ 3.32
TPGS1-201ENST00000359315 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
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TPGS1-201ENST00000359315 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.31
TPGS1-201ENST00000359315 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
TPGS1-201ENST00000359315 KCNQ3O43525 872 aa35.75■■■■□ 3.31
TPGS1-201ENST00000359315 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
TPGS1-201ENST00000359315 SLC16A10Q8TF71 515 aa35.75■■■■□ 3.31
TPGS1-201ENST00000359315 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
TPGS1-201ENST00000359315 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa35.75■■■■□ 3.31
TPGS1-201ENST00000359315 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
TPGS1-201ENST00000359315 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
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TPGS1-201ENST00000359315 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF790Q6PG37 636 aa35.73■■■■□ 3.31
TPGS1-201ENST00000359315 SSFA2P28290 1259 aa35.72■■■■□ 3.31
TPGS1-201ENST00000359315 CRKLP46109 303 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
TPGS1-201ENST00000359315 MSL1Q68DK7 614 aa35.72■■■■□ 3.31
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
TPGS1-201ENST00000359315 BTBD11A6QL63 1104 aa35.71■■■■□ 3.31
TPGS1-201ENST00000359315 TTC5Q8N0Z6 440 aa35.71■■■■□ 3.31
TPGS1-201ENST00000359315 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
TPGS1-201ENST00000359315 UBR2Q8IWV8 1755 aa35.71■■■■□ 3.31
TPGS1-201ENST00000359315 ANP32CO43423 234 aa35.7■■■■□ 3.31
TPGS1-201ENST00000359315 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
TPGS1-201ENST00000359315 FLAD1Q8NFF5 587 aa35.7■■■■□ 3.31
TPGS1-201ENST00000359315 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
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TPGS1-201ENST00000359315 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
TPGS1-201ENST00000359315 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
TPGS1-201ENST00000359315 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
TPGS1-201ENST00000359315 HEG1Q9ULI3 1381 aa35.65■■■■□ 3.3
TPGS1-201ENST00000359315 RPS6KA4O75676 772 aa35.65■■■■□ 3.3
TPGS1-201ENST00000359315 RIPK4P57078 832 aa35.65■■■■□ 3.3
TPGS1-201ENST00000359315 VSIG10Q8N0Z9 540 aa35.65■■■■□ 3.3
TPGS1-201ENST00000359315 RUNDC1Q96C34 613 aa35.65■■■■□ 3.3
TPGS1-201ENST00000359315 MIS18AQ9NYP9 233 aa35.65■■■■□ 3.3
TPGS1-201ENST00000359315 DLG5Q8TDM6 1919 aa35.65■■■■□ 3.3
TPGS1-201ENST00000359315 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
TPGS1-201ENST00000359315 ARXQ96QS3 562 aa35.62■■■■□ 3.29
TPGS1-201ENST00000359315 COL24A1Q17RW2 1714 aa35.62■■■■□ 3.29
TPGS1-201ENST00000359315 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
TPGS1-201ENST00000359315 FMNL2Q96PY5 1086 aa35.61■■■■□ 3.29
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC87Q9NVE4 849 aa35.61■■■■□ 3.29
TPGS1-201ENST00000359315 NEUROD2Q15784 382 aa35.6■■■■□ 3.29
TPGS1-201ENST00000359315 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa35.6■■■■□ 3.29
TPGS1-201ENST00000359315 TRAPPC3LQ5T215 181 aa35.59■■■■□ 3.29
TPGS1-201ENST00000359315 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa35.58■■■■□ 3.29
TPGS1-201ENST00000359315 POLD1P28340 1107 aa35.58■■■■□ 3.29
TPGS1-201ENST00000359315 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
TPGS1-201ENST00000359315 MRS2Q9HD23 443 aa35.57■■■■□ 3.28
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