RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356245.7

G3BP1-201, Transcript of G3BP stress granule assembly factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene G3BP1, Length 2,803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1-201ENST00000356245 TMEM94Q12767 1356 aa14.82□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 RABEP1Q15276 862 aa14.81□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 USP26Q9BXU7 913 aa14.81□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 TSHZ3Q63HK5 1081 aa14.81□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 MCTP1Q6DN14 999 aa14.81□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 CASC1Q6TDU7 716 aa14.81□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 G2E3Q7L622 706 aa14.81□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.8□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 AK9Q5TCS8 1911 aa14.8□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 BAG4O95429 457 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 ATF3P18847 181 aa14.79□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 HOXC9P31274 260 aa14.79□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 PKP1Q13835 747 aa14.79□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 RTL1A6NKG5 1358 aa14.79□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 C1orf167Q5SNV9 1468 aa14.79□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 EYA1Q99502 592 aa14.79□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.78□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa14.78□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 ATP10DQ9P241 1426 aa14.78□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.78□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 KRT28Q7Z3Y7 464 aa14.77□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
G3BP1-201ENST00000356245 KIF24Q5T7B8 1368 aa14.77□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 RGS12O14924 1447 aa14.77□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 LMOD2Q6P5Q4 547 aa14.77□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 PTPRCP08575 1304 aa14.77□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 HMMRO75330 724 aa14.76□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 ARHGEF10O15013 1369 aa14.76□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 ST18O60284 1047 aa14.76□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 PTMSP20962 102 aa14.76□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 CHAMP1Q96JM3 812 aa14.76□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 RGPD1P0DJD0 1748 aa14.76□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 USP54Q70EL1 1684 aa14.76□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 ESPNB1AK53 854 aa14.75□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 KCNH5Q8NCM2 988 aa14.75□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 IGSF1Q8N6C5 1336 aa14.75□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 ERBB4Q15303 1308 aa14.75□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 REC8O95072 547 aa14.74□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 GCP02774 474 aa14.74□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 CADPS2Q86UW7 1296 aa14.74□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 IP6K1Q92551 441 aa14.74□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 KDRP35968 1356 aa14.74□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 ERC2O15083 957 aa14.74□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 NASPP49321 788 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 NUCB2P80303 420 aa14.74□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 STK31Q9BXU1 1019 aa14.74□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 MST1RQ04912 1400 aa14.74□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 PDE1AP54750 535 aa14.73□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 KIAA0232Q92628 1395 aa14.73□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 RILPL2Q969X0 211 aa14.73□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa14.73□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 KLHL40Q2TBA0 621 aa14.73□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 DCCP43146 1447 aa14.72□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 NEK4P51957 841 aa14.72□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 STRCQ7RTU9 1775 aa14.72□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 ZBTB7CA1YPR0 619 aa14.72□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 GNAI2P04899 355 aa14.72□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 NFAT5O94916 1531 aa14.71□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 CRB1P82279 1406 aa14.71□□□□□ -0.05
G3BP1-201ENST00000356245 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-201ENST00000356245 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-201ENST00000356245 ARHGEF25Q86VW2 580 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-201ENST00000356245 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-201ENST00000356245 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-201ENST00000356245 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-201ENST00000356245 ANO2Q9NQ90 1003 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-201ENST00000356245 FLIIQ13045 1269 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-201ENST00000356245 LMBRD1Q9NUN5 540 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-201ENST00000356245 KIF1AQ12756 1690 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-201ENST00000356245 USHBP1Q8N6Y0 703 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-201ENST00000356245 LRRCC1Q9C099 1032 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-201ENST00000356245 LTN1O94822 1766 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-201ENST00000356245 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa14.68□□□□□ -0.06
G3BP1-201ENST00000356245 NBPF6Q5VWK0 638 aa14.68□□□□□ -0.06
G3BP1-201ENST00000356245 NBPF4Q96M43 638 aa14.68□□□□□ -0.06
G3BP1-201ENST00000356245 PDCL3Q9H2J4 239 aa14.68□□□□□ -0.06
G3BP1-201ENST00000356245 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
G3BP1-201ENST00000356245 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
G3BP1-201ENST00000356245 CLEC17AQ6ZS10 378 aa14.68□□□□□ -0.06
G3BP1-201ENST00000356245 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa14.68□□□□□ -0.06
G3BP1-201ENST00000356245 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
G3BP1-201ENST00000356245 MX1P20591 662 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms