RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 GNAI2P04899 355 aa27.05■■□□□ 1.92
SPHK1-201ENST00000323374 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
SPHK1-201ENST00000323374 TEFQ10587 303 aa27.05■■□□□ 1.92
SPHK1-201ENST00000323374 CHMP4AQ9BY43 222 aa27.05■■□□□ 1.92
SPHK1-201ENST00000323374 TBC1D2Q9BYX2 928 aa27.05■■□□□ 1.92
SPHK1-201ENST00000323374 DCCP43146 1447 aa27.05■■□□□ 1.92
SPHK1-201ENST00000323374 HOXB7P09629 217 aa27.05■■□□□ 1.92
SPHK1-201ENST00000323374 DEKP35659 375 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
SPHK1-201ENST00000323374 C1orf141Q5JVX7 400 aa27.05■■□□□ 1.92
SPHK1-201ENST00000323374 AXIN2Q9Y2T1 843 aa27.05■■□□□ 1.92
SPHK1-201ENST00000323374 GNAI3P08754 354 aa27.04■■□□□ 1.92
SPHK1-201ENST00000323374 RBM25P49756 843 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
SPHK1-201ENST00000323374 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa27.02■■□□□ 1.92
SPHK1-201ENST00000323374 ALS2Q96Q42 1657 aa27.02■■□□□ 1.92
SPHK1-201ENST00000323374 PXDNLA1KZ92 1463 aa27.02■■□□□ 1.92
SPHK1-201ENST00000323374 BTBD11A6QL63 1104 aa27.01■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa27.01■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa27.01■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 RNMTO43148 476 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 KDM3BQ7LBC6 1761 aa27■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 CDC45O75419 566 aa27■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa27■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 TTC22Q5TAA0 569 aa26.99■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.99■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 ERBB3P21860 1342 aa26.99■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 PXDNQ92626 1479 aa26.99■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.98■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 APBB1O00213 710 aa26.97■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 BCL11AQ9H165 835 aa26.97■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 KCNQ3O43525 872 aa26.96■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 NPHP3Q7Z494 1330 aa26.95■■□□□ 1.9
SPHK1-201ENST00000323374 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
SPHK1-201ENST00000323374 ATP8B2P98198 1209 aa26.94■■□□□ 1.9
SPHK1-201ENST00000323374 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
SPHK1-201ENST00000323374 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
SPHK1-201ENST00000323374 ANTXR1Q9H6X2 564 aa26.93■■□□□ 1.9
SPHK1-201ENST00000323374 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.93■■□□□ 1.9
SPHK1-201ENST00000323374 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.92■■□□□ 1.9
SPHK1-201ENST00000323374 USP44Q9H0E7 712 aa26.92■■□□□ 1.9
SPHK1-201ENST00000323374 HSCBQ8IWL3 235 aa26.92■■□□□ 1.9
SPHK1-201ENST00000323374 RGPD5Q99666 1765 aa26.91■■□□□ 1.9
SPHK1-201ENST00000323374 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
SPHK1-201ENST00000323374 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.91■■□□□ 1.9
SPHK1-201ENST00000323374 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.9■■□□□ 1.9
SPHK1-201ENST00000323374 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
SPHK1-201ENST00000323374 HSPA2P54652 639 aa26.9■■□□□ 1.9
SPHK1-201ENST00000323374 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.9■■□□□ 1.9
SPHK1-201ENST00000323374 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
SPHK1-201ENST00000323374 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.89■■□□□ 1.9
SPHK1-201ENST00000323374 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa26.89■■□□□ 1.9
SPHK1-201ENST00000323374 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.89■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 SNX21Q969T3 373 aa26.89■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 OSBPL3Q9H4L5 887 aa26.88■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.87■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 LRRCC1Q9C099 1032 aa26.87■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 SDSP20132 328 aa26.87■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 HEG1Q9ULI3 1381 aa26.86■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.86■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 CASC1Q6TDU7 716 aa26.86■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.86■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.85■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 PDE1AP54750 535 aa26.84■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 BEND3Q5T5X7 828 aa26.84■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 KIF2CQ99661 725 aa26.84■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.84■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.84■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.83■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.83■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 SPG7Q9UQ90 795 aa26.83■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 ANXA1P04083 346 aa26.83■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.83■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 COL18A1P39060 1754 aa26.82■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 ABCC6O95255 1503 aa26.82■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 SSH3Q8TE77 659 aa26.82■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 ADCY9O60503 1353 aa26.81■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.8■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 PHKG2P15735 406 aa26.8■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 SALL3Q9BXA9 1300 aa26.8■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 CHRNA2Q15822 529 aa26.79■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.78■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 MX1P20591 662 aa26.78■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 POLA2Q14181 598 aa26.78■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.78■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 HYPKQ9NX55 129 aa26.78■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 CHMP5Q9NZZ3 219 aa26.78■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 CPDO75976 1380 aa26.78■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 MEGF6O75095 1541 aa26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms