RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 GNAI2P04899 355 aa27.05■■□□□ 1.92
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SPHK1-201ENST00000323374 TEFQ10587 303 aa27.05■■□□□ 1.92
SPHK1-201ENST00000323374 CHMP4AQ9BY43 222 aa27.05■■□□□ 1.92
SPHK1-201ENST00000323374 TBC1D2Q9BYX2 928 aa27.05■■□□□ 1.92
SPHK1-201ENST00000323374 DCCP43146 1447 aa27.05■■□□□ 1.92
SPHK1-201ENST00000323374 HOXB7P09629 217 aa27.05■■□□□ 1.92
SPHK1-201ENST00000323374 DEKP35659 375 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
SPHK1-201ENST00000323374 C1orf141Q5JVX7 400 aa27.05■■□□□ 1.92
SPHK1-201ENST00000323374 AXIN2Q9Y2T1 843 aa27.05■■□□□ 1.92
SPHK1-201ENST00000323374 GNAI3P08754 354 aa27.04■■□□□ 1.92
SPHK1-201ENST00000323374 RBM25P49756 843 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
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SPHK1-201ENST00000323374 ALS2Q96Q42 1657 aa27.02■■□□□ 1.92
SPHK1-201ENST00000323374 PXDNLA1KZ92 1463 aa27.02■■□□□ 1.92
SPHK1-201ENST00000323374 BTBD11A6QL63 1104 aa27.01■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa27.01■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa27.01■■□□□ 1.91
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SPHK1-201ENST00000323374 CDC45O75419 566 aa27■■□□□ 1.91
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SPHK1-201ENST00000323374 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
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SPHK1-201ENST00000323374 TTC22Q5TAA0 569 aa26.99■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.99■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 ERBB3P21860 1342 aa26.99■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 PXDNQ92626 1479 aa26.99■■□□□ 1.91
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SPHK1-201ENST00000323374 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.98■■□□□ 1.91
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SPHK1-201ENST00000323374 BCL11AQ9H165 835 aa26.97■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 KCNQ3O43525 872 aa26.96■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
SPHK1-201ENST00000323374 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
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SPHK1-201ENST00000323374 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
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SPHK1-201ENST00000323374 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.92■■□□□ 1.9
SPHK1-201ENST00000323374 USP44Q9H0E7 712 aa26.92■■□□□ 1.9
SPHK1-201ENST00000323374 HSCBQ8IWL3 235 aa26.92■■□□□ 1.9
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SPHK1-201ENST00000323374 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.89■■□□□ 1.89
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SPHK1-201ENST00000323374 LRRCC1Q9C099 1032 aa26.87■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
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SPHK1-201ENST00000323374 HEG1Q9ULI3 1381 aa26.86■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.86■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 CASC1Q6TDU7 716 aa26.86■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.86■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.85■■□□□ 1.89
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SPHK1-201ENST00000323374 BEND3Q5T5X7 828 aa26.84■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 KIF2CQ99661 725 aa26.84■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.84■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.84■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.83■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.83■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 SPG7Q9UQ90 795 aa26.83■■□□□ 1.89
SPHK1-201ENST00000323374 ANXA1P04083 346 aa26.83■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.83■■□□□ 1.88
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SPHK1-201ENST00000323374 ABCC6O95255 1503 aa26.82■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 SSH3Q8TE77 659 aa26.82■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 ADCY9O60503 1353 aa26.81■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.8■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 PHKG2P15735 406 aa26.8■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 SALL3Q9BXA9 1300 aa26.8■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 CHRNA2Q15822 529 aa26.79■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.78■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 MX1P20591 662 aa26.78■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 POLA2Q14181 598 aa26.78■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.78■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 HYPKQ9NX55 129 aa26.78■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 CHMP5Q9NZZ3 219 aa26.78■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 CPDO75976 1380 aa26.78■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 MEGF6O75095 1541 aa26.78■■□□□ 1.88
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