RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 ARHGAP45Q92619 1136 aa18.42■□□□□ 0.54
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HOXA3-201ENST00000317201 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
HOXA3-201ENST00000317201 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
HOXA3-201ENST00000317201 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
HOXA3-201ENST00000317201 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
HOXA3-201ENST00000317201 ABCA3Q99758 1704 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXA3-201ENST00000317201 USHBP1Q8N6Y0 703 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXA3-201ENST00000317201 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
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HOXA3-201ENST00000317201 BCL2L13Q9BXK5 485 aa18.4■□□□□ 0.54
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HOXA3-201ENST00000317201 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
HOXA3-201ENST00000317201 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
HOXA3-201ENST00000317201 TSPYL6Q8N831 410 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXA3-201ENST00000317201 C8orf58Q8NAV2 365 aa18.38■□□□□ 0.53
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HOXA3-201ENST00000317201 AKAP4Q5JQC9 854 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXA3-201ENST00000317201 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
HOXA3-201ENST00000317201 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
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HOXA3-201ENST00000317201 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
HOXA3-201ENST00000317201 TRIM27P14373 513 aa18.36■□□□□ 0.53
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HOXA3-201ENST00000317201 COG6Q9Y2V7 657 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXA3-201ENST00000317201 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
HOXA3-201ENST00000317201 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
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HOXA3-201ENST00000317201 RLBP1P12271 317 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXA3-201ENST00000317201 CABLES1Q8TDN4 633 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXA3-201ENST00000317201 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP18.36■□□□□ 0.53
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HOXA3-201ENST00000317201 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
HOXA3-201ENST00000317201 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
HOXA3-201ENST00000317201 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXA3-201ENST00000317201 DDX19BQ9UMR2 479 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 C1orf141Q5JVX7 400 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 TNNQ9UQP3 1299 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 KDM3BQ7LBC6 1761 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 NLRP2Q9NX02 1062 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 PKD1L3Q7Z443 1732 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 TATP17735 454 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 PRDM11Q9NQV5 511 aa18.3■□□□□ 0.52
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HOXA3-201ENST00000317201 ABCC4O15439 1325 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 WDR17Q8IZU2 1322 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 ZBTB22O15209 634 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 CHRNA2Q15822 529 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 CHMP4AQ9BY43 222 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 SPG7Q9UQ90 795 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 PTPRCP08575 1304 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 FSD2A1L4K1 749 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 RNMTO43148 476 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 HOXB7P09629 217 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 MEGF6O75095 1541 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXA3-201ENST00000317201 MIS18AQ9NYP9 233 aa18.27■□□□□ 0.51
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM57Q8N5G2 664 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXA3-201ENST00000317201 KRT24Q2M2I5 525 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXA3-201ENST00000317201 LGR6Q9HBX8 967 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXA3-201ENST00000317201 CACNA1FO60840 1977 aa18.25■□□□□ 0.51
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HOXA3-201ENST00000317201 ITPRIPQ8IWB1 547 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXA3-201ENST00000317201 SCN11AQ9UI33 1791 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXA3-201ENST00000317201 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa18.24■□□□□ 0.51
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HOXA3-201ENST00000317201 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
HOXA3-201ENST00000317201 CCDC30Q5VVM6 783 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXA3-201ENST00000317201 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa18.23■□□□□ 0.51
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HOXA3-201ENST00000317201 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
HOXA3-201ENST00000317201 MRC1P22897 1456 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXA3-201ENST00000317201 RGS12O14924 1447 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXA3-201ENST00000317201 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
HOXA3-201ENST00000317201 PHKG2P15735 406 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXA3-201ENST00000317201 NCLP19338 710 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
HOXA3-201ENST00000317201 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXA3-201ENST00000317201 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXA3-201ENST00000317201 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
HOXA3-201ENST00000317201 IGHDP01880 384 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXA3-201ENST00000317201 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
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