RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC30Q5VVM6 783 aa27.73■■■□□ 2.03
GADD45GIP1-201ENST00000316939 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STK31Q9BXU1 1019 aa27.71■■■□□ 2.03
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BTBD11A6QL63 1104 aa27.69■■■□□ 2.02
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PHKG2P15735 406 aa27.69■■■□□ 2.02
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHMP4AQ9BY43 222 aa27.69■■■□□ 2.02
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MRC1P22897 1456 aa27.69■■■□□ 2.02
GADD45GIP1-201ENST00000316939 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SKAP1Q86WV1 359 aa27.68■■■□□ 2.02
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IFNL2Q8IZJ0 200 aa27.68■■■□□ 2.02
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HEG1Q9ULI3 1381 aa27.66■■■□□ 2.02
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CARD10Q9BWT7 1032 aa27.65■■■□□ 2.02
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa27.65■■■□□ 2.02
GADD45GIP1-201ENST00000316939 G2E3Q7L622 706 aa27.63■■■□□ 2.01
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa27.63■■■□□ 2.01
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PHLPP1O60346 1717 aa27.62■■■□□ 2.01
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP27B1O15528 508 aa27.62■■■□□ 2.01
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNQ3O43525 872 aa27.62■■■□□ 2.01
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DCAF5Q96JK2 942 aa27.62■■■□□ 2.01
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC52A2Q9HAB3 445 aa27.62■■■□□ 2.01
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FLIIQ13045 1269 aa27.61■■■□□ 2.01
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SHANK3Q9BYB0 1731 aa27.6■■■□□ 2.01
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PXDNLA1KZ92 1463 aa27.6■■■□□ 2.01
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMC5Q8IY18 1101 aa27.6■■■□□ 2.01
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDE4AP27815 886 aa27.59■■■□□ 2.01
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCT4P50991 539 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BACH2Q9BYV9 841 aa27.58■■■□□ 2.01
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa27.58■■■□□ 2.01
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa27.58■■■□□ 2.01
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RGS3P49796 1198 aa27.57■■■□□ 2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EVA1CP58658 441 aa27.57■■■□□ 2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa27.57■■■□□ 2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IL2RBP14784 551 aa27.56■■■□□ 2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NECTIN2Q92692 538 aa27.55■■■□□ 2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STRN4Q9NRL3 753 aa27.55■■■□□ 2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF790Q6PG37 636 aa27.53■■■□□ 2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLCH1Q4KWH8 1693 aa27.53■■■□□ 2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa27.53■■■□□ 2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP10DQ9P241 1426 aa27.52■■■□□ 2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C5P01031 1676 aa27.52■■■□□ 2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 F6X3S4 739 aa27.52■■■□□ 2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C1orf115Q9H7X2 142 aa27.52■■■□□ 2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BTG4Q9NY30 223 aa27.52■■■□□ 2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TOM1O60784 492 aa27.51■■□□□ 1.99
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SIRT2Q8IXJ6 389 aa27.5■■□□□ 1.99
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHPF2Q9P2E5 772 aa27.5■■□□□ 1.99
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GCC1Q96CN9 775 aa27.5■■□□□ 1.99
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM161AQ3B820 660 aa27.48■■□□□ 1.99
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC4A10Q6U841 1118 aa27.48■■□□□ 1.99
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MEIS3Q99687 375 aa27.48■■□□□ 1.99
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WNK3Q9BYP7 1800 aa27.47■■□□□ 1.99
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PAPPAQ13219 1627 aa27.46■■□□□ 1.99
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUCB1Q02818 461 aa27.46■■□□□ 1.99
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBR2Q8IWV8 1755 aa27.46■■□□□ 1.99
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GLI3P10071 1580 aa27.46■■□□□ 1.99
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DISP2A7MBM2 1401 aa27.46■■□□□ 1.99
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERVV-2B6SEH9 535 aa27.45■■□□□ 1.99
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CABP4P57796 275 aa27.45■■□□□ 1.99
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC39A6Q13433 755 aa27.45■■□□□ 1.99
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKRD44Q8N8A2 993 aa27.45■■□□□ 1.99
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LAMB4A4D0S4 1761 aa27.45■■□□□ 1.98
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C8orf34Q49A92 452 aa27.45■■□□□ 1.98
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NRAPQ86VF7 1730 aa27.44■■□□□ 1.98
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CEP85Q6P2H3 762 aa27.43■■□□□ 1.98
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTC5Q8N0Z6 440 aa27.43■■□□□ 1.98
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa27.42■■□□□ 1.98
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HYPKQ9NX55 129 aa27.42■■□□□ 1.98
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa27.42■■□□□ 1.98
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GNAI3P08754 354 aa27.41■■□□□ 1.98
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP27.4■■□□□ 1.98
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NWD2Q9ULI1 1742 aa27.4■■□□□ 1.98
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHD1LQ86WJ1 897 aa27.4■■□□□ 1.98
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FMNL2Q96PY5 1086 aa27.4■■□□□ 1.98
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DCTPP1Q9H773 170 aa27.39■■□□□ 1.98
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADCY9O60503 1353 aa27.39■■□□□ 1.98
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GNAI2P04899 355 aa27.38■■□□□ 1.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNAAF4Q8WXU2 420 aa27.38■■□□□ 1.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PIP4K2BP78356 416 aa27.37■■□□□ 1.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDIA6Q15084 440 aa27.37■■□□□ 1.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PI4KAP2A4QPH2 592 aa27.37■■□□□ 1.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PROSER3Q2NL68 480 aa27.37■■□□□ 1.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms