RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298564.14

TSPAN17-201, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17-201ENST00000298564 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 G2E3Q7L622 706 aa21.92■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 C14orf37Q86TY3 774 aa21.91■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.91■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 CEP85Q6P2H3 762 aa21.9■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.9■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.9■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa21.9■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 ATP10DQ9P241 1426 aa21.9■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 F6X3S4 739 aa21.89■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.89■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
TSPAN17-201ENST00000298564 MSNP26038 577 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
TSPAN17-201ENST00000298564 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
TSPAN17-201ENST00000298564 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
TSPAN17-201ENST00000298564 RTL1A6NKG5 1358 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN17-201ENST00000298564 CCDC173Q0VFZ6 552 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN17-201ENST00000298564 RBSNQ9H1K0 784 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN17-201ENST00000298564 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
TSPAN17-201ENST00000298564 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
TSPAN17-201ENST00000298564 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
TSPAN17-201ENST00000298564 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
TSPAN17-201ENST00000298564 ZSCAN30Q86W11 494 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN17-201ENST00000298564 MPNDQ8N594 471 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN17-201ENST00000298564 FAM13BQ9NYF5 915 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN17-201ENST00000298564 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN17-201ENST00000298564 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
TSPAN17-201ENST00000298564 KLHL40Q2TBA0 621 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN17-201ENST00000298564 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa21.86■■□□□ 1.09
TSPAN17-201ENST00000298564 NECTIN2Q92692 538 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN17-201ENST00000298564 CDC45O75419 566 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN17-201ENST00000298564 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN17-201ENST00000298564 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN17-201ENST00000298564 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
TSPAN17-201ENST00000298564 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
TSPAN17-201ENST00000298564 RNF214Q8ND24 703 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN17-201ENST00000298564 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
TSPAN17-201ENST00000298564 IL17REQ8NFR9 667 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN17-201ENST00000298564 PPP1R9BQ96SB3 815 aa21.83■■□□□ 1.09
TSPAN17-201ENST00000298564 STK31Q9BXU1 1019 aa21.83■■□□□ 1.09
TSPAN17-201ENST00000298564 TTC22Q5TAA0 569 aa21.83■■□□□ 1.08
TSPAN17-201ENST00000298564 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.83■■□□□ 1.08
TSPAN17-201ENST00000298564 LMBRD1Q9NUN5 540 aa21.82■■□□□ 1.08
TSPAN17-201ENST00000298564 CCT4P50991 539 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
TSPAN17-201ENST00000298564 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
TSPAN17-201ENST00000298564 NWD1Q149M9 1564 aa21.8■■□□□ 1.08
TSPAN17-201ENST00000298564 GPT2Q8TD30 523 aa21.8■■□□□ 1.08
TSPAN17-201ENST00000298564 TPM2P07951 284 aa21.79■■□□□ 1.08
TSPAN17-201ENST00000298564 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.79■■□□□ 1.08
TSPAN17-201ENST00000298564 MAP3K5Q99683 1374 aa21.79■■□□□ 1.08
TSPAN17-201ENST00000298564 SYCE3A1L190 88 aa21.79■■□□□ 1.08
TSPAN17-201ENST00000298564 FLIIQ13045 1269 aa21.79■■□□□ 1.08
TSPAN17-201ENST00000298564 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
TSPAN17-201ENST00000298564 OFD1O75665 1012 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN17-201ENST00000298564 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
TSPAN17-201ENST00000298564 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN17-201ENST00000298564 USP26Q9BXU7 913 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN17-201ENST00000298564 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN17-201ENST00000298564 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
TSPAN17-201ENST00000298564 HMMRO75330 724 aa21.77■■□□□ 1.08
TSPAN17-201ENST00000298564 PSME1Q06323 249 aa21.77■■□□□ 1.08
TSPAN17-201ENST00000298564 ZDHHC9Q9Y397 364 aa21.76■■□□□ 1.07
TSPAN17-201ENST00000298564 SDSP20132 328 aa21.76■■□□□ 1.07
TSPAN17-201ENST00000298564 PLEKHG5O94827 1062 aa21.75■■□□□ 1.07
TSPAN17-201ENST00000298564 GNAI2P04899 355 aa21.75■■□□□ 1.07
TSPAN17-201ENST00000298564 IP6K1Q92551 441 aa21.75■■□□□ 1.07
TSPAN17-201ENST00000298564 PDCL3Q9H2J4 239 aa21.75■■□□□ 1.07
TSPAN17-201ENST00000298564 RABEP1Q15276 862 aa21.75■■□□□ 1.07
TSPAN17-201ENST00000298564 NBPF6Q5VWK0 638 aa21.75■■□□□ 1.07
TSPAN17-201ENST00000298564 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
TSPAN17-201ENST00000298564 NBPF4Q96M43 638 aa21.75■■□□□ 1.07
TSPAN17-201ENST00000298564 TMEM63CQ9P1W3 806 aa21.75■■□□□ 1.07
TSPAN17-201ENST00000298564 PTMSP20962 102 aa21.74■■□□□ 1.07
TSPAN17-201ENST00000298564 LRRC37A3O60309 1634 aa21.73■■□□□ 1.07
TSPAN17-201ENST00000298564 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa21.73■■□□□ 1.07
TSPAN17-201ENST00000298564 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF445P59923 1031 aa21.72■■□□□ 1.07
TSPAN17-201ENST00000298564 NUCB2P80303 420 aa21.72■■□□□ 1.07
TSPAN17-201ENST00000298564 GDPD2Q9HCC8 539 aa21.71■■□□□ 1.07
TSPAN17-201ENST00000298564 UQCRHLA0A096LP55 91 aa21.71■■□□□ 1.07
TSPAN17-201ENST00000298564 UQCRHP07919 91 aa21.71■■□□□ 1.07
TSPAN17-201ENST00000298564 LGR6Q9HBX8 967 aa21.71■■□□□ 1.07
TSPAN17-201ENST00000298564 USP54Q70EL1 1684 aa21.71■■□□□ 1.07
TSPAN17-201ENST00000298564 DTNBO60941 627 aa21.7■■□□□ 1.07
TSPAN17-201ENST00000298564 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.07
TSPAN17-201ENST00000298564 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.7■■□□□ 1.07
TSPAN17-201ENST00000298564 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
TSPAN17-201ENST00000298564 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.7■■□□□ 1.06
TSPAN17-201ENST00000298564 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa21.7■■□□□ 1.06
TSPAN17-201ENST00000298564 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
TSPAN17-201ENST00000298564 GNAI3P08754 354 aa21.7■■□□□ 1.06
TSPAN17-201ENST00000298564 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
TSPAN17-201ENST00000298564 LTN1O94822 1766 aa21.69■■□□□ 1.06
TSPAN17-201ENST00000298564 CLEC17AQ6ZS10 378 aa21.69■■□□□ 1.06
TSPAN17-201ENST00000298564 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
TSPAN17-201ENST00000298564 NEK4P51957 841 aa21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms