RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285243.6

ANKRD40-201, Transcript of ankyrin repeat domain 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD40, Length 4,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40-201ENST00000285243 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
ANKRD40-201ENST00000285243 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
ANKRD40-201ENST00000285243 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.91■■□□□ 1.26
ANKRD40-201ENST00000285243 EYA1Q99502 592 aa22.9■■□□□ 1.26
ANKRD40-201ENST00000285243 A0A087WZG4 1122 aa22.9■■□□□ 1.26
ANKRD40-201ENST00000285243 FERMT3Q86UX7 667 aa22.9■■□□□ 1.26
ANKRD40-201ENST00000285243 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ANKRD40-201ENST00000285243 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.9■■□□□ 1.26
ANKRD40-201ENST00000285243 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.9■■□□□ 1.26
ANKRD40-201ENST00000285243 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.9■■□□□ 1.26
ANKRD40-201ENST00000285243 MBD5Q9P267 1494 aa22.89■■□□□ 1.26
ANKRD40-201ENST00000285243 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
ANKRD40-201ENST00000285243 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.89■■□□□ 1.26
ANKRD40-201ENST00000285243 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.89■■□□□ 1.26
ANKRD40-201ENST00000285243 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.89■■□□□ 1.26
ANKRD40-201ENST00000285243 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.89■■□□□ 1.26
ANKRD40-201ENST00000285243 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
ANKRD40-201ENST00000285243 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.89■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 ORAI2Q96SN7 254 aa22.89■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.88■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.88■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.88■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.88■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 ERICH2A1L162 156 aa22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 PDE4CQ08493 712 aa22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 SYCE3A1L190 88 aa22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 PSMA5P28066 241 aa22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 VAMP4O75379 141 aa22.86■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 TPM4P67936 248 aa22.86■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 SNRKQ9NRH2 765 aa22.86■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 ABCF2Q9UG63 623 aa22.86■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 ZNF521Q96K83 1311 aa22.86■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 DDX11Q96FC9 970 aa22.86■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.85■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 SDF4Q9BRK5 362 aa22.85■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.83■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
ANKRD40-201ENST00000285243 ZNF592Q92610 1267 aa22.83■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 SNX21Q969T3 373 aa22.83■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.83■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 LTKP29376 864 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 GCP02774 474 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 TTC22Q5TAA0 569 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 G2E3Q7L622 706 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 STARD3NLO95772 234 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 METTL24Q5JXM2 366 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 COPS6Q7L5N1 327 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.8■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.79■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 NPATQ14207 1427 aa22.79■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 NGLY1Q96IV0 654 aa22.79■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.79■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 CLCN1P35523 988 aa22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 MAP7D2Q96T17 732 aa22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.78■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 SDSP20132 328 aa22.77■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.77■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.77■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.77■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 ATP7AQ04656 1500 aa22.77■■□□□ 1.24
ANKRD40-201ENST00000285243 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 HIP1O00291 1037 aa22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms