RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.42■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa20.42■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.42■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 SMC5Q8IY18 1101 aa20.42■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa20.41■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 FLIIQ13045 1269 aa20.41■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 KDM5CP41229 1560 aa20.41■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 MSH6P52701 1360 aa20.41■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.41■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 IL16Q14005 1332 aa20.4■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.39■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 FLT4P35916 1363 aa20.39■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 INSRP06213 1382 aa20.39■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 ERVK-7P63135 1459 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 SLC39A6Q13433 755 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 RNF20Q5VTR2 975 aa20.38■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 APPP05067 770 aa20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 PLXNC1O60486 1568 aa20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC192P0DO97 292 aa20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 MCM5P33992 734 aa20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 IL13P35225 146 aa20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 HOMER1Q86YM7 354 aa20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 FBXW7Q969H0 707 aa20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 USP25Q9UHP3 1055 aa20.37■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 CNTROBQ8N137 903 aa20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 HOXC9P31274 260 aa20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 FSD1Q9BTV5 496 aa20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 ABCC3O15438 1527 aa20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 OFD1O75665 1012 aa20.36■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 CBX1P83916 185 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 PI4KAP2A4QPH2 592 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 G3V3G9 751 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 DYNC1I1O14576 645 aa20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 VAMP4O75379 141 aa20.34■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.34■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.34■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.34■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 VPS37DQ86XT2 251 aa20.34■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa20.33■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 DNAAF4Q8WXU2 420 aa20.33■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.33■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.33■□□□□ 0.85
TRPC1-201ENST00000273482 WASHC4Q2M389 1173 aa20.33■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa20.33■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 PDCP20941 246 aa20.32■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 PLEKHG3A1L390 1219 aa20.32■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 MEIS3Q99687 375 aa20.32■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 FOSBP53539 338 aa20.32■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.32■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 MYD88Q99836 296 aa20.32■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.32■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.32■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 IQGAP3Q86VI3 1631 aa20.32■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC112Q8NEF3 446 aa20.31■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 EFCAB6Q5THR3 1501 aa20.31■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 RBM25P49756 843 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 ZFYVE9O95405 1425 aa20.3■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 AACSQ86V21 672 aa20.3■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 MYOM2P54296 1465 aa20.3■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 TTC22Q5TAA0 569 aa20.3■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 ROBO2Q9HCK4 1378 aa20.3■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 KRT85P78386 507 aa20.29■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.29■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 NGLY1Q96IV0 654 aa20.29■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.29■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 TET3O43151 1660 aa20.29■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 IP6K1Q92551 441 aa20.29■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 TNMDQ9H2S6 317 aa20.29■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 CLTCL1P53675 1640 aa20.29■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.29■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC183Q5T5S1 534 aa20.28■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 TEX35Q5T0J7 233 aa20.28■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 KIF1BO60333 1816 aa20.28■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms