RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
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TRPC1-201ENST00000273482 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa20.42■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.42■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 SMC5Q8IY18 1101 aa20.42■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
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TRPC1-201ENST00000273482 ABCC3O15438 1527 aa20.36■□□□□ 0.85
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TRPC1-201ENST00000273482 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa20.35■□□□□ 0.85
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TRPC1-201ENST00000273482 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
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TRPC1-201ENST00000273482 CLTCL1P53675 1640 aa20.29■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.29■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
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TRPC1-201ENST00000273482 KIF1BO60333 1816 aa20.28■□□□□ 0.84
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TRPC1-201ENST00000273482 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
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