RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000068411.4

Ccdc88c-201, Transcript of Protein Daple, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc88c, Length 7,542 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Tmem67Q8BR76 992 aa14.67□□□□□ -0.06
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 TnikP83510 1323 aa14.67□□□□□ -0.06
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Wdr33Q8K4P0 1330 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Wasf1Q8R5H6 559 aa14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Polr3dQ91WD1 398 aa14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Prkar2bP31324 416 aa14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Tshz3Q8CGV9 1081 aa14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Jakmip2D3YXK0 820 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 NapbP28663 298 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 TxlnaQ6PAM1 554 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Ccdc158Q8CDI6 1109 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Ccdc172Q810N9 267 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Tmc2Q8R4P4 888 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 2310002L09RikQ9D7L5 217 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Stxbp4Q9WV89 557 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 GlmnQ8BZM1 596 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Cep120Q7TSG1 988 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Rcan3Q9JKK0 239 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Cacna2d4Q5RJF7 1116 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 PrxO55103 1391 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Ccdc66Q6NS45 935 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Cct4P80315 539 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Cep131Q62036 1060 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Matr3Q8K310 846 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Sh3d21Q7TSG5 549 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Smarca2Q6DIC0 1577 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Fchsd2Q3USJ8 740 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Fam170aQ66LM6 333 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Mcm10Q0VBD2 885 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 TchpQ3TVW5 497 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Dph6Q9CQ28 267 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Ercc3P49135 783 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Fam184aE9PW83 1143 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Hand2Q61039 217 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Naip1Q9QWK5 1403 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Bag3Q9JLV1 577 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Zeb2Q9R0G7 1215 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 InsrP15208 1372 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Maats1Q8BRC6 783 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Lrrfip1Q3UZ39 729 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Riok1Q922Q2 567 aa14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Jakmip3Q5DTN8 844 aa14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Tacc1Q6Y685 774 aa14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Trim11Q99PQ2 467 aa14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Klhl10Q9D5V2 608 aa14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Ripk4Q9ERK0 786 aa14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Gm18336A0A140LIU8 765 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Ccdc83Q9D4V3 305 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Ccdc112A0AUP1 442 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Ccne1Q61457 408 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Dnaaf4Q8R368 420 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Sall3Q62255 1320 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Zscan29E9Q5B4 869 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 GnpatP98192 678 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Tsg101Q61187 391 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Pet2A2AHY8 747 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Mcm4P49717 862 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 NcapgE9PWG6 1004 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Adcy5P84309 1262 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 EvcP57680 1005 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Rasa1E9PYG6 1038 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 L1td1Q587J6 782 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Ppm1eQ80TL0 749 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 NsmfQ99NF2 532 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Plekhg5Q66T02 1073 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Fam177a1Q8BR63 207 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 GptQ8QZR5 496 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Skor1Q8BX46 964 aa14.58□□□□□ -0.07
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Hvcn1Q3U2S8 269 aa14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 RalylQ8BTF8 293 aa14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Nap1l5Q9JJF0 156 aa14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Sdc2P43407 202 aa14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Fam107bQ3TGF2 131 aa14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Fam43aQ8BUP8 424 aa14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Vps16Q920Q4 839 aa14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Slc5a1Q8C3K6 665 aa14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Arglu1Q3UL36 271 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Soga3Q6NZL0 945 aa14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Ddx10Q80Y44 875 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Ano2Q8CFW1 1002 aa14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Hspa4Q61316 841 aa14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Pus7B7ZNL8 666 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Ccdc93Q7TQK5 629 aa14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 TprnA2AI08 749 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Znf526Q8BI66 675 aa14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Rad23bP54728 416 aa14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Paip2Q9D6V8 124 aa14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 94.1 ms