RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000038107.8

Cited2-201, Transcript of Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cited2, Length 1,979 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2-201ENSMUST00000038107 Rabep1O35551 862 aa29.03■■■□□ 2.24
Cited2-201ENSMUST00000038107 Gcc1Q9D4H2 778 aa29.03■■■□□ 2.24
Cited2-201ENSMUST00000038107 Col1a2Q01149 1372 aa29.03■■■□□ 2.24
Cited2-201ENSMUST00000038107 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
Cited2-201ENSMUST00000038107 Irx6Q9ER75 438 aa29.02■■■□□ 2.24
Cited2-201ENSMUST00000038107 Abca15E9PWH4 1668 aa29.01■■■□□ 2.23
Cited2-201ENSMUST00000038107 Bcl9lQ67FY2 1494 aa29.01■■■□□ 2.23
Cited2-201ENSMUST00000038107 CoilQ5SU73 570 aa29.01■■■□□ 2.23
Cited2-201ENSMUST00000038107 FanclQ9CR14 375 aa29.01■■■□□ 2.23
Cited2-201ENSMUST00000038107 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
Cited2-201ENSMUST00000038107 Mre11Q61216 706 aa29■■■□□ 2.23
Cited2-201ENSMUST00000038107 BcorQ8CGN4 1759 aa28.99■■■□□ 2.23
Cited2-201ENSMUST00000038107 Cyp2d11P24457 504 aa28.99■■■□□ 2.23
Cited2-201ENSMUST00000038107 Mcm2P97310 904 aa28.99■■■□□ 2.23
Cited2-201ENSMUST00000038107 ThemisQ8BGW0 636 aa28.99■■■□□ 2.23
Cited2-201ENSMUST00000038107 Sptbn5F6UCX4 1208 aa28.98■■■□□ 2.23
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ccdc146E9Q9F7 977 aa28.97■■■□□ 2.23
Cited2-201ENSMUST00000038107 Pdzd9Q9D9M4 266 aa28.97■■■□□ 2.23
Cited2-201ENSMUST00000038107 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
Cited2-201ENSMUST00000038107 Stk36Q69ZM6 1316 aa28.96■■■□□ 2.23
Cited2-201ENSMUST00000038107 FocadA2AKG8 1798 aa28.96■■■□□ 2.23
Cited2-201ENSMUST00000038107 Tnks1bp1P58871 1720 aa28.94■■■□□ 2.22
Cited2-201ENSMUST00000038107 Fkbp4P30416 458 aa28.93■■■□□ 2.22
Cited2-201ENSMUST00000038107 Zranb3Q6NZP1 1069 aa28.93■■■□□ 2.22
Cited2-201ENSMUST00000038107 Slit1Q80TR4 1531 aa28.93■■■□□ 2.22
Cited2-201ENSMUST00000038107 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa28.93■■■□□ 2.22
Cited2-201ENSMUST00000038107 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
Cited2-201ENSMUST00000038107 Tns2Q8CGB6 1400 aa28.93■■■□□ 2.22
Cited2-201ENSMUST00000038107 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
Cited2-201ENSMUST00000038107 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa28.91■■■□□ 2.22
Cited2-201ENSMUST00000038107 Kif2cQ922S8 721 aa28.91■■■□□ 2.22
Cited2-201ENSMUST00000038107 Echdc1Q9D9V3 322 aa28.91■■■□□ 2.22
Cited2-201ENSMUST00000038107 Tmem119Q8R138 280 aa28.9■■■□□ 2.22
Cited2-201ENSMUST00000038107 Phkg2Q9DB30 406 aa28.9■■■□□ 2.22
Cited2-201ENSMUST00000038107 Nek4Q9Z1J2 792 aa28.9■■■□□ 2.22
Cited2-201ENSMUST00000038107 Atg4a-psA0A0G2JFS9 396 aa28.9■■■□□ 2.22
Cited2-201ENSMUST00000038107 PsapQ61207 557 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ccdc155Q80VJ8 648 aa28.9■■■□□ 2.22
Cited2-201ENSMUST00000038107 Atg4aQ8C9S8 396 aa28.9■■■□□ 2.22
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa28.9■■■□□ 2.22
Cited2-201ENSMUST00000038107 ArxO35085 564 aa28.89■■■□□ 2.22
Cited2-201ENSMUST00000038107 Atp8b2P98199 1209 aa28.89■■■□□ 2.22
Cited2-201ENSMUST00000038107 Srgap3Q812A2 1099 aa28.89■■■□□ 2.22
Cited2-201ENSMUST00000038107 Chmp7Q8R1T1 451 aa28.88■■■□□ 2.21
Cited2-201ENSMUST00000038107 GckrQ91X44 587 aa28.88■■■□□ 2.21
Cited2-201ENSMUST00000038107 Atp10bB1AWN4 1474 aa28.88■■■□□ 2.21
Cited2-201ENSMUST00000038107 RgmbQ7TQ33 436 aa28.88■■■□□ 2.21
Cited2-201ENSMUST00000038107 Nphp1Q9QY53 687 aa28.88■■■□□ 2.21
Cited2-201ENSMUST00000038107 Cadps2Q8BYR5 1297 aa28.87■■■□□ 2.21
Cited2-201ENSMUST00000038107 Atg3Q9CPX6 314 aa28.87■■■□□ 2.21
Cited2-201ENSMUST00000038107 CenppQ9CZ92 286 aa28.86■■■□□ 2.21
Cited2-201ENSMUST00000038107 Mmp8O70138 465 aa28.84■■■□□ 2.21
Cited2-201ENSMUST00000038107 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa28.84■■■□□ 2.21
Cited2-201ENSMUST00000038107 Taf7Q9R1C0 341 aa28.84■■■□□ 2.21
Cited2-201ENSMUST00000038107 Bend3Q6PAL0 825 aa28.83■■■□□ 2.21
Cited2-201ENSMUST00000038107 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa28.83■■■□□ 2.21
Cited2-201ENSMUST00000038107 Adcy9P51830 1353 aa28.83■■■□□ 2.21
Cited2-201ENSMUST00000038107 Bcl2l13P59017 434 aa28.82■■■□□ 2.2
Cited2-201ENSMUST00000038107 Fam50bQ9WTJ8 334 aa28.82■■■□□ 2.2
Cited2-201ENSMUST00000038107 Cwc27Q3TKY6 469 aa28.82■■■□□ 2.2
Cited2-201ENSMUST00000038107 Zfp142G5E869 1843 aa28.82■■■□□ 2.2
Cited2-201ENSMUST00000038107 Anapc15-psA0A140T8L6 141 aa28.81■■■□□ 2.2
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa28.81■■■□□ 2.2
Cited2-201ENSMUST00000038107 Flt4P35917 1363 aa28.81■■■□□ 2.2
Cited2-201ENSMUST00000038107 Plekhd1B2RPU2 505 aa28.81■■■□□ 2.2
Cited2-201ENSMUST00000038107 Exoc6bA6H5Z3 810 aa28.8■■■□□ 2.2
Cited2-201ENSMUST00000038107 Txnrd1Q9JMH6 613 aa28.79■■■□□ 2.2
Cited2-201ENSMUST00000038107 Gm10093D3YYI8 482 aa28.79■■■□□ 2.2
Cited2-201ENSMUST00000038107 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
Cited2-201ENSMUST00000038107 Zap70P43404 618 aa28.79■■■□□ 2.2
Cited2-201ENSMUST00000038107 SympkQ80X82 1284 aa28.79■■■□□ 2.2
Cited2-201ENSMUST00000038107 Asic4Q7TNS7 539 aa28.77■■■□□ 2.2
Cited2-201ENSMUST00000038107 ZgpatQ8VDM1 511 aa28.77■■■□□ 2.2
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ssfa2Q922B9 1252 aa28.77■■■□□ 2.2
Cited2-201ENSMUST00000038107 HdgfP51859 237 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
Cited2-201ENSMUST00000038107 Iqsec3Q3TES0 1195 aa28.76■■■□□ 2.19
Cited2-201ENSMUST00000038107 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
Cited2-201ENSMUST00000038107 Mcmdc2E9Q956 681 aa28.75■■■□□ 2.19
Cited2-201ENSMUST00000038107 Pdia6Q922R8 440 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
Cited2-201ENSMUST00000038107 Map3k2Q61083 619 aa28.75■■■□□ 2.19
Cited2-201ENSMUST00000038107 Irf9Q61179 399 aa28.75■■■□□ 2.19
Cited2-201ENSMUST00000038107 Zpr1Q62384 459 aa28.75■■■□□ 2.19
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ier5O89113 308 aa28.74■■■□□ 2.19
Cited2-201ENSMUST00000038107 Pdia3P27773 505 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
Cited2-201ENSMUST00000038107 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
Cited2-201ENSMUST00000038107 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
Cited2-201ENSMUST00000038107 Bcar3Q9QZK2 820 aa28.73■■■□□ 2.19
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ppp6r3Q922D4 844 aa28.73■■■□□ 2.19
Cited2-201ENSMUST00000038107 Bcl11bQ99PV8 884 aa28.72■■■□□ 2.19
Cited2-201ENSMUST00000038107 GorabQ8BRM2 368 aa28.71■■■□□ 2.19
Cited2-201ENSMUST00000038107 Gimap5Q8BWF2 308 aa28.71■■■□□ 2.19
Cited2-201ENSMUST00000038107 TefQ9JLC6 301 aa28.71■■■□□ 2.19
Cited2-201ENSMUST00000038107 Tlr7P58681 1050 aa28.71■■■□□ 2.19
Cited2-201ENSMUST00000038107 Nucb1Q02819 459 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
Cited2-201ENSMUST00000038107 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
Cited2-201ENSMUST00000038107 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa28.7■■■□□ 2.18
Cited2-201ENSMUST00000038107 Zkscan2G3X952 960 aa28.7■■■□□ 2.18
Cited2-201ENSMUST00000038107 HellsQ60848 821 aa28.7■■■□□ 2.18
Cited2-201ENSMUST00000038107 Morc2aQ69ZX6 1030 aa28.7■■■□□ 2.18
Cited2-201ENSMUST00000038107 Slx1bQ8BX32 270 aa28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.2 ms