RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vamp4O70480 141 aa15.27■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CrklP47941 303 aa15.27■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cers3Q1A3B0 383 aa15.26■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spty2d1Q68FG3 682 aa15.26■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bcar3Q9QZK2 820 aa15.26■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kif3aP28741 701 aa15.26■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smarcc1P97496 1104 aa15.26■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cep170Q6A065 1588 aa15.26■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 A0A1L1SQF0 893 aa15.26■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp7a1Q64505 503 aa15.26■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Krt84Q99M73 603 aa15.26■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wdr78E9PYY5 807 aa15.25■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem87bQ8BKU8 555 aa15.25■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa15.25■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pik3r4Q8VD65 1358 aa15.25■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NaspQ99MD9 773 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gabpb2P81069 414 aa15.25■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrrcc1Q69ZB0 1026 aa15.25■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Isy1Q69ZQ2 285 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fsd1Q7TPM6 496 aa15.24■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AidaQ8C4Q6 305 aa15.24■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fsd2Q8BZ52 692 aa15.24■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa15.24■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Qtrt2B8ZXI1 415 aa15.24■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpatch11Q3UFS4 262 aa15.24■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sptbn5F6UCX4 1208 aa15.23■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hook1Q8BIL5 728 aa15.23■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcna6Q61923 529 aa15.23■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ImmtQ8CAQ8 757 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smc2Q8CG48 1191 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cfap65Q3V0B4 1847 aa15.23■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kdm5cP41230 1554 aa15.23■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SfswapQ3USH5 945 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cavin2Q63918 418 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Il1rapl2Q9ERS6 686 aa15.22■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wdr17E9Q271 1322 aa15.22■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam13aQ8BGI4 693 aa15.22■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Uggt2E9Q4X2 1504 aa15.22■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Igflr1Q3U4N7 345 aa15.22■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sel1lQ9Z2G6 790 aa15.22■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tnni2P13412 182 aa15.22■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zc3h12cQ5DTV4 884 aa15.22■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc7a3P70423 618 aa15.21■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kif20aP97329 887 aa15.21■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ncbp1Q3UYV9 790 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gimap8Q75N62 688 aa15.21■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pms1Q8K119 917 aa15.21■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Col17a1Q07563 1470 aa15.21■□□□□ 0.03
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa15.21■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp10aO54827 1508 aa15.2■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Grm8P47743 908 aa15.2■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tpm1P58771 284 aa15.2■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tpm2P58774 284 aa15.2■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cnnm3Q32NY4 713 aa15.2■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tbc1d7Q9D0K0 293 aa15.2■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stk38Q91VJ4 465 aa15.2■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnf214Q8BFU3 668 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MsnP26041 577 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcnn1Q9EQR3 537 aa15.19■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plekho1Q9JIY0 408 aa15.19■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa15.19■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gas2l2Q5SSG4 860 aa15.19■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tpm4Q6IRU2 248 aa15.19■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ginm1Q91WR6 327 aa15.19■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ankrd50F7BE84 1390 aa15.19■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 FanclQ9CR14 375 aa15.18■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rad17Q6NXW6 688 aa15.18■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem67Q8BR76 992 aa15.18■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Golim4Q8BXA1 655 aa15.18■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ubxn4Q8VCH8 506 aa15.18■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 IkQ9Z1M8 557 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NapbP28663 298 aa15.18■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cep57l1Q8VDS7 400 aa15.18■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ttc5Q99LG4 440 aa15.18■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ripk4Q9ERK0 786 aa15.18■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wdr63B2RY71 923 aa15.17■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Snap23O09044 210 aa15.17■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rbm26Q6NZN0 1012 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 March6Q6ZQ89 909 aa15.17■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc14a2Q8R4T9 930 aa15.17■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa15.17■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Card10P58660 1021 aa15.17■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gjb2Q00977 226 aa15.17■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cep131Q62036 1060 aa15.17■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trim27Q62158 513 aa15.17■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prkab2Q6PAM0 271 aa15.17■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc39a6Q8C145 765 aa15.17■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pof1bQ8K4L4 587 aa15.17■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Speer4dL7N216 212 aa15.17■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Becn1O88597 448 aa15.17■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa15.17■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf335A2A5K6 1337 aa15.16■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa15.16■□□□□ 0.02
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ParvgQ9ERD8 331 aa15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 7.7 ms