Protein–RNA interactions for Protein: Q14DL3

Lrriq3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq3Q14DL3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Lrriq3Q14DL3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Lrriq3Q14DL3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lrriq3Q14DL3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Lrriq3Q14DL3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Lrriq3Q14DL3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Lrriq3Q14DL3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lrriq3Q14DL3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Lrriq3Q14DL3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Lrriq3Q14DL3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Lrriq3Q14DL3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Lrriq3Q14DL3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Lrriq3Q14DL3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Lrriq3Q14DL3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Lrriq3Q14DL3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Lrriq3Q14DL3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Lrriq3Q14DL3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Lrriq3Q14DL3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lrriq3Q14DL3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Lrriq3Q14DL3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Lrriq3Q14DL3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lrriq3Q14DL3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Lrriq3Q14DL3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Lrriq3Q14DL3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Lrriq3Q14DL3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Lrriq3Q14DL3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Lrriq3Q14DL3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lrriq3Q14DL3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Lrriq3Q14DL3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lrriq3Q14DL3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lrriq3Q14DL3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lrriq3Q14DL3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Lrriq3Q14DL3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Lrriq3Q14DL3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lrriq3Q14DL3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Lrriq3Q14DL3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lrriq3Q14DL3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lrriq3Q14DL3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.37
Lrriq3Q14DL3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Lrriq3Q14DL3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lrriq3Q14DL3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lrriq3Q14DL3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Lrriq3Q14DL3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lrriq3Q14DL3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lrriq3Q14DL3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lrriq3Q14DL3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lrriq3Q14DL3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lrriq3Q14DL3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lrriq3Q14DL3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lrriq3Q14DL3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Lrriq3Q14DL3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lrriq3Q14DL3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrriq3Q14DL3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Lrriq3Q14DL3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrriq3Q14DL3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lrriq3Q14DL3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrriq3Q14DL3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrriq3Q14DL3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrriq3Q14DL3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrriq3Q14DL3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrriq3Q14DL3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrriq3Q14DL3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrriq3Q14DL3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lrriq3Q14DL3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lrriq3Q14DL3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrriq3Q14DL3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Lrriq3Q14DL3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lrriq3Q14DL3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrriq3Q14DL3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrriq3Q14DL3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrriq3Q14DL3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lrriq3Q14DL3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lrriq3Q14DL3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lrriq3Q14DL3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lrriq3Q14DL3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrriq3Q14DL3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrriq3Q14DL3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrriq3Q14DL3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lrriq3Q14DL3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lrriq3Q14DL3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lrriq3Q14DL3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrriq3Q14DL3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrriq3Q14DL3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lrriq3Q14DL3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lrriq3Q14DL3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrriq3Q14DL3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrriq3Q14DL3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrriq3Q14DL3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrriq3Q14DL3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrriq3Q14DL3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrriq3Q14DL3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrriq3Q14DL3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrriq3Q14DL3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrriq3Q14DL3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrriq3Q14DL3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrriq3Q14DL3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrriq3Q14DL3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrriq3Q14DL3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrriq3Q14DL3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrriq3Q14DL3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
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