Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ppp4r2Q0VGB7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ppp4r2Q0VGB7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ppp4r2Q0VGB7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ppp4r2Q0VGB7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ppp4r2Q0VGB7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ppp4r2Q0VGB7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ppp4r2Q0VGB7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ppp4r2Q0VGB7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ppp4r2Q0VGB7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ppp4r2Q0VGB7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Ppp4r2Q0VGB7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ppp4r2Q0VGB7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ppp4r2Q0VGB7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ppp4r2Q0VGB7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ppp4r2Q0VGB7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ppp4r2Q0VGB7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ppp4r2Q0VGB7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ppp4r2Q0VGB7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ppp4r2Q0VGB7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ppp4r2Q0VGB7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ppp4r2Q0VGB7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Ppp4r2Q0VGB7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ppp4r2Q0VGB7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ppp4r2Q0VGB7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ppp4r2Q0VGB7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ppp4r2Q0VGB7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Ppp4r2Q0VGB7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Ppp4r2Q0VGB7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ppp4r2Q0VGB7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ppp4r2Q0VGB7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ppp4r2Q0VGB7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ppp4r2Q0VGB7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ppp4r2Q0VGB7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ppp4r2Q0VGB7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ppp4r2Q0VGB7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ppp4r2Q0VGB7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ppp4r2Q0VGB7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ppp4r2Q0VGB7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ppp4r2Q0VGB7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ppp4r2Q0VGB7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Ppp4r2Q0VGB7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ppp4r2Q0VGB7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ppp4r2Q0VGB7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ppp4r2Q0VGB7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ppp4r2Q0VGB7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ppp4r2Q0VGB7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ppp4r2Q0VGB7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ppp4r2Q0VGB7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ppp4r2Q0VGB7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ppp4r2Q0VGB7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ppp4r2Q0VGB7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ppp4r2Q0VGB7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ppp4r2Q0VGB7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Ppp4r2Q0VGB7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Ppp4r2Q0VGB7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ppp4r2Q0VGB7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ppp4r2Q0VGB7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ppp4r2Q0VGB7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Ppp4r2Q0VGB7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Ppp4r2Q0VGB7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ppp4r2Q0VGB7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Ppp4r2Q0VGB7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ppp4r2Q0VGB7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ppp4r2Q0VGB7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ppp4r2Q0VGB7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ppp4r2Q0VGB7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Ppp4r2Q0VGB7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ppp4r2Q0VGB7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ppp4r2Q0VGB7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ppp4r2Q0VGB7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ppp4r2Q0VGB7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ppp4r2Q0VGB7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ppp4r2Q0VGB7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ppp4r2Q0VGB7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ppp4r2Q0VGB7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ppp4r2Q0VGB7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ppp4r2Q0VGB7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ppp4r2Q0VGB7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ppp4r2Q0VGB7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ppp4r2Q0VGB7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ppp4r2Q0VGB7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ppp4r2Q0VGB7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ppp4r2Q0VGB7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ppp4r2Q0VGB7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ppp4r2Q0VGB7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ppp4r2Q0VGB7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ppp4r2Q0VGB7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ppp4r2Q0VGB7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ppp4r2Q0VGB7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ppp4r2Q0VGB7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ppp4r2Q0VGB7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ppp4r2Q0VGB7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ppp4r2Q0VGB7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 214.4 ms