Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.98
ChgaP26339 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ChgaP26339 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ChgaP26339 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ChgaP26339 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ChgaP26339 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ChgaP26339 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ChgaP26339 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ChgaP26339 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ChgaP26339 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ChgaP26339 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ChgaP26339 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ChgaP26339 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ChgaP26339 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ChgaP26339 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ChgaP26339 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
ChgaP26339 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ChgaP26339 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
ChgaP26339 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ChgaP26339 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ChgaP26339 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ChgaP26339 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ChgaP26339 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
ChgaP26339 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ChgaP26339 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ChgaP26339 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ChgaP26339 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ChgaP26339 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ChgaP26339 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ChgaP26339 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ChgaP26339 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
ChgaP26339 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ChgaP26339 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ChgaP26339 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ChgaP26339 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ChgaP26339 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ChgaP26339 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ChgaP26339 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ChgaP26339 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ChgaP26339 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ChgaP26339 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ChgaP26339 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
ChgaP26339 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ChgaP26339 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ChgaP26339 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ChgaP26339 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ChgaP26339 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ChgaP26339 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ChgaP26339 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ChgaP26339 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ChgaP26339 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ChgaP26339 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
ChgaP26339 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ChgaP26339 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ChgaP26339 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ChgaP26339 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ChgaP26339 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ChgaP26339 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ChgaP26339 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ChgaP26339 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ChgaP26339 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ChgaP26339 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ChgaP26339 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ChgaP26339 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
ChgaP26339 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
ChgaP26339 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ChgaP26339 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ChgaP26339 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ChgaP26339 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ChgaP26339 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ChgaP26339 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ChgaP26339 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ChgaP26339 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ChgaP26339 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ChgaP26339 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ChgaP26339 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ChgaP26339 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ChgaP26339 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ChgaP26339 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
ChgaP26339 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ChgaP26339 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ChgaP26339 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ChgaP26339 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
ChgaP26339 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ChgaP26339 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ChgaP26339 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ChgaP26339 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ChgaP26339 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ChgaP26339 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
ChgaP26339 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
ChgaP26339 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ChgaP26339 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ChgaP26339 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ChgaP26339 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ChgaP26339 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ChgaP26339 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ChgaP26339 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ChgaP26339 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ChgaP26339 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
ChgaP26339 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms