Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CGGBP1Q9UFW8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
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