Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
HERC1Q15751 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
HERC1Q15751 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
HERC1Q15751 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
HERC1Q15751 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
HERC1Q15751 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
HERC1Q15751 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
HERC1Q15751 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-1.6□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
HERC1Q15751 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
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