Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-3.25□□□□□ -2.93
ZFHX3Q15911 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
ZFHX3Q15911 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
ZFHX3Q15911 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
ZFHX3Q15911 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
ZFHX3Q15911 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
ZFHX3Q15911 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
ZFHX3Q15911 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
ZFHX3Q15911 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
ZFHX3Q15911 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
ZFHX3Q15911 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
ZFHX3Q15911 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
ZFHX3Q15911 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
ZFHX3Q15911 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
ZFHX3Q15911 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
ZFHX3Q15911 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
ZFHX3Q15911 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
ZFHX3Q15911 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
ZFHX3Q15911 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
ZFHX3Q15911 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
ZFHX3Q15911 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
ZFHX3Q15911 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-3.3□□□□□ -2.94
ZFHX3Q15911 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
ZFHX3Q15911 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.3□□□□□ -2.94
ZFHX3Q15911 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
ZFHX3Q15911 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
ZFHX3Q15911 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
ZFHX3Q15911 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
ZFHX3Q15911 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
ZFHX3Q15911 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
ZFHX3Q15911 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
ZFHX3Q15911 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
ZFHX3Q15911 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
ZFHX3Q15911 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
ZFHX3Q15911 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
ZFHX3Q15911 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
ZFHX3Q15911 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
ZFHX3Q15911 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
ZFHX3Q15911 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.34□□□□□ -2.94
ZFHX3Q15911 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
ZFHX3Q15911 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
ZFHX3Q15911 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
ZFHX3Q15911 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
ZFHX3Q15911 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
ZFHX3Q15911 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
ZFHX3Q15911 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
ZFHX3Q15911 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
ZFHX3Q15911 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
ZFHX3Q15911 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
ZFHX3Q15911 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
ZFHX3Q15911 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
ZFHX3Q15911 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
ZFHX3Q15911 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
ZFHX3Q15911 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
ZFHX3Q15911 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
ZFHX3Q15911 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-3.39□□□□□ -2.95
ZFHX3Q15911 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
ZFHX3Q15911 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
ZFHX3Q15911 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
ZFHX3Q15911 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
ZFHX3Q15911 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
ZFHX3Q15911 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
ZFHX3Q15911 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
ZFHX3Q15911 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
ZFHX3Q15911 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
ZFHX3Q15911 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
ZFHX3Q15911 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
ZFHX3Q15911 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
ZFHX3Q15911 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
ZFHX3Q15911 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
ZFHX3Q15911 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
ZFHX3Q15911 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
ZFHX3Q15911 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
ZFHX3Q15911 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
ZFHX3Q15911 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
ZFHX3Q15911 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
ZFHX3Q15911 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
ZFHX3Q15911 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
ZFHX3Q15911 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.97
ZFHX3Q15911 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
ZFHX3Q15911 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-3.48□□□□□ -2.97
ZFHX3Q15911 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
ZFHX3Q15911 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
ZFHX3Q15911 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
ZFHX3Q15911 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
ZFHX3Q15911 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
ZFHX3Q15911 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
ZFHX3Q15911 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
ZFHX3Q15911 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
ZFHX3Q15911 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
ZFHX3Q15911 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
ZFHX3Q15911 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
ZFHX3Q15911 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
ZFHX3Q15911 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
ZFHX3Q15911 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
ZFHX3Q15911 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
ZFHX3Q15911 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
ZFHX3Q15911 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
ZFHX3Q15911 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
ZFHX3Q15911 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
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