Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC-1.47□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
HERC1Q15751 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
HERC1Q15751 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC-1.47□□□□□ -2.65
HERC1Q15751 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
HERC1Q15751 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
HERC1Q15751 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
HERC1Q15751 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
HERC1Q15751 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
HERC1Q15751 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
HERC1Q15751 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
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