Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SPTAN1Q13813 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SPTAN1Q13813 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SPTAN1Q13813 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
SPTAN1Q13813 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
SPTAN1Q13813 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
SPTAN1Q13813 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
SPTAN1Q13813 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
SPTAN1Q13813 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
SPTAN1Q13813 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
SPTAN1Q13813 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SPTAN1Q13813 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SPTAN1Q13813 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SPTAN1Q13813 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SPTAN1Q13813 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SPTAN1Q13813 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-3.59□□□□□ -2.98
SPTAN1Q13813 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SPTAN1Q13813 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.63□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC-3.66□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-3.66□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-3.66□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC-3.66□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-3.66□□□□□ -2.99
SPTAN1Q13813 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC-3.66□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC-3.69□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.7□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-3.71□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
SPTAN1Q13813 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-3.72□□□□□ -3.01
SPTAN1Q13813 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-3.72□□□□□ -3.01
SPTAN1Q13813 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-3.72□□□□□ -3.01
SPTAN1Q13813 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-3.72□□□□□ -3.01
SPTAN1Q13813 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SPTAN1Q13813 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SPTAN1Q13813 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SPTAN1Q13813 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SPTAN1Q13813 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC-3.74□□□□□ -3.01
SPTAN1Q13813 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SPTAN1Q13813 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
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