Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms