Protein–RNA interactions for Protein: Q13671

RIN1, Ras and Rab interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN1Q13671 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RIN1Q13671 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RIN1Q13671 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RIN1Q13671 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RIN1Q13671 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RIN1Q13671 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIN1Q13671 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIN1Q13671 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIN1Q13671 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIN1Q13671 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIN1Q13671 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIN1Q13671 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIN1Q13671 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RIN1Q13671 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RIN1Q13671 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RIN1Q13671 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RIN1Q13671 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.72□□□□□ -2.29
RIN1Q13671 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RIN1Q13671 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RIN1Q13671 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RIN1Q13671 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.71□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIN1Q13671 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RIN1Q13671 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RIN1Q13671 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RIN1Q13671 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RIN1Q13671 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RIN1Q13671 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RIN1Q13671 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
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RIN1Q13671 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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RIN1Q13671 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RIN1Q13671 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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RIN1Q13671 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIN1Q13671 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIN1Q13671 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIN1Q13671 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIN1Q13671 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIN1Q13671 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIN1Q13671 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIN1Q13671 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIN1Q13671 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIN1Q13671 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIN1Q13671 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIN1Q13671 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIN1Q13671 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
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RIN1Q13671 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RIN1Q13671 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RIN1Q13671 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RIN1Q13671 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RIN1Q13671 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
RIN1Q13671 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RIN1Q13671 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RIN1Q13671 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RIN1Q13671 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RIN1Q13671 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RIN1Q13671 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RIN1Q13671 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RIN1Q13671 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RIN1Q13671 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RIN1Q13671 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RIN1Q13671 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RIN1Q13671 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RIN1Q13671 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RIN1Q13671 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RIN1Q13671 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RIN1Q13671 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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